_IDPredictionOTHERSPmTPCS_Position
EDI_315480OTHER0.9999940.0000020.000004
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  • Fasta :-

    >EDI_315480 MTEEKDFKVFDVENENKKNQDIQYGFNEYESKLSSNGITGDINIMLSSTKEKDTDIEKMN HIVKEISEENYFCYIRSEYEKFLLEFTTTNMKRLSDQFCKEFFNKNIKVFFNKIKKETMY TELILKFMTFYLNLFFSRIELVDEEGWKLFGDIFSCEEFKKTRSVYNIETTKYVDQTPLV VEFIIEINKIDGFNNIYEMIRLYDLKLLNSMLTSVSYIFSNDNTYLIEEQRTEIAKSIYE RIQELDCKTCSIQLIKSFISVAEHFLNTEYIDYSICSLLVQSLNSFDQRMTFFNSATRLL KELTSEWVKEDLNKYNLSEKQQEDPFKTQNEIVELFIPCLSILNESIQKQILITALPIFD FLCKHGKKLEIFERYLMIIGSGHISIVEVIIPIFKSMIEEELNDETFSLVISTLRRVEDK TIGHFELFCDLVEKNVLVLNELFDLFINKSDIEISQMALLFSKIIEVTEDNPLFNELINK TKEFINGLYKEEKSIVFCEAVFALLIEHSQSRIFNEKGINEIFMKVITDNIQMECTTRRK AIVSGALNVLLGMSLIDIELPLTLFSELWEVFMNQNIVQEFKSQLFLFFINFFSKDSDAK EEVNKEVLIKNGEGYKFNGNLNDIAHLIPLKRLLIITNNKVTEEKAMDLLIAIVKSVPVQ FGWKVVIEWIKNNNQLYSQSHDDKLKKEQVINLNVLNALLIEWTSTSEGKAISHVRSLKG KPMLFNVIIKKGEKVIMKNQIKILSSLSIGEIKKSIEKEFKIDVDKSTIEIDGVDDFDET TSISDLLLQNESEIILKMAKEESDGSLFRSNELPSSQYYKKEIRMEDVKTLVEMTGVSKQ IAYCALKKYLYYSNAVDLAFSALFDDIESITAAYTKDLENGEIYDIPDDEEVPKEEVDLS FIRLVSDSDEILIIVECLKKHFGEEVEKIVWKIMMSLPSFSGVMKKVNSCFVMNESYGPK GVFDLLTEQSDYTLLYTLQLVDKILFPEKDNESSTTTDTIKSQTLLREIIVKSQPIFDQI CLAFRSVLRRESNLIVDIIETFSKIFSFFIHKLCKHQQLTFDVTENYELFDECFDIILKN PNNPHISGVFISISSSICELRNKGSSIIVVPDLHEFLIQYFNSQQKYDEEQVITGSFITS LVNLYQSNSILLYDQTQKLIKDLFNALELYGTKRAMYFYTKTICLLIKSIKENVIDFQEV FDYVIQKICTIEPNEQFTDDSDYYITGLLKIANLLLPKVEIVPEKISLTVSKLFNNCYGN PLKYKLKSVRNSSYDLINNIFQICSNLINTFSTEVFDKCFQYKIIKKLDIVPKSSRTGYR GIRNIGSTCYINSVLQQLFMMKEFREKILRLVSTDTMKVTKQLQKLFISLKGGSQDCYNA DLLIDEIQKHKKVYDLKVQQHDACDFLIMLLDCLEDEMNKGSQQQIFPIFTLKTIIQTDS LDSAIKENRETKEEFRTLPLPIQGKRNVEQCLSNFFKPEFFKGDNRLRTDDGRYFNAVKQ YKIESLPHYLFLQLNRFDSFDVNVMKINDKCEIPLTLDLNKYMKNKNLNGEYCLNGVVIH TGNAGYGHYFSYILNDRKWIEFNDSRVSYISGDMATRNMNGGYKDFGGYLLVYEKKNYQE EQSRDQVGEDILKELKIEEEKISNDVMYHDNQCLKLILKQSKSFDPIIMKKTIIYCFRYS FSLLGEGEQNNGLVDEVIEGVKNYNNPEIGKKVLEDVIQNDFVSLYCINSLESIRTRASE LIVTAIRWVAESDSVNLFSETEILYRFYQSLKSLLMFSRLYPKNLKQYFILFDALASIGP QACYSLSKMGLVKSFWYYFLNKNEDTEESVSAIVLDVFPDLKYFVTTLQKVICSCYTDDH DEQITPFSNTQNSEYLDNSYSKYKNLIFSGDLLLQLIAYNYDSGCILLKHISYNNFDASL NIINQFKDCIQSRKQEKSLLKKFNNCSPSSKMKLSFAIRMSKKLPYVKQMLLENTMVLEK MINYLNQFFRCNYQIYNENLYEQDFIGYGKYIIQNVTEKIKQEPEFQELTYLLELVNERS SMSFDIDALEQEIKETKEELKPLKENQPRSSIPTKVVSDYLN
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  • MitoProt II - v1.101 File : /home/rajan/sadaf/4480_mitoprot/test/EDI_315480.fa Sequence name : EDI_315480 Sequence length : 2082 VALUES OF COMPUTED PARAMETERS Coef20 : 2.810 CoefTot : 0.000 ChDiff : -58 ZoneTo : 2 KR : 0 DE : 0 CleavSite : 0 HYDROPHOBIC SCALE USED GES KD GVH1 ECS H17 : 1.318 1.882 0.216 0.752 MesoH : -0.287 0.839 -0.284 0.357 MuHd_075 : 16.546 6.176 4.755 2.840 MuHd_095 : 10.806 7.104 2.342 0.797 MuHd_100 : 14.995 8.546 4.363 1.747 MuHd_105 : 14.665 8.488 5.401 2.836 Hmax_075 : -14.117 -2.333 -7.166 -0.093 Hmax_095 : -18.200 -4.500 -7.811 -1.514 Hmax_100 : -12.000 -1.300 -5.931 -0.230 Hmax_105 : -16.000 -1.700 -6.270 -0.315 CLASS NOT-MITO MITO(/CHLORO) DFM : 0.9959 0.0041 DFMC : 0.9893 0.0107
  • ##### ProP v.1.0b ProPeptide Cleavage Site Prediction ##### ##### Furin-type cleavage site prediction (Arginine/Lysine residues) ##### 2082 EDI_315480 MTEEKDFKVFDVENENKKNQDIQYGFNEYESKLSSNGITGDINIMLSSTKEKDTDIEKMNHIVKEISEENYFCYIRSEYE 80 KFLLEFTTTNMKRLSDQFCKEFFNKNIKVFFNKIKKETMYTELILKFMTFYLNLFFSRIELVDEEGWKLFGDIFSCEEFK 160 KTRSVYNIETTKYVDQTPLVVEFIIEINKIDGFNNIYEMIRLYDLKLLNSMLTSVSYIFSNDNTYLIEEQRTEIAKSIYE 240 RIQELDCKTCSIQLIKSFISVAEHFLNTEYIDYSICSLLVQSLNSFDQRMTFFNSATRLLKELTSEWVKEDLNKYNLSEK 320 QQEDPFKTQNEIVELFIPCLSILNESIQKQILITALPIFDFLCKHGKKLEIFERYLMIIGSGHISIVEVIIPIFKSMIEE 400 ELNDETFSLVISTLRRVEDKTIGHFELFCDLVEKNVLVLNELFDLFINKSDIEISQMALLFSKIIEVTEDNPLFNELINK 480 TKEFINGLYKEEKSIVFCEAVFALLIEHSQSRIFNEKGINEIFMKVITDNIQMECTTRRKAIVSGALNVLLGMSLIDIEL 560 PLTLFSELWEVFMNQNIVQEFKSQLFLFFINFFSKDSDAKEEVNKEVLIKNGEGYKFNGNLNDIAHLIPLKRLLIITNNK 640 VTEEKAMDLLIAIVKSVPVQFGWKVVIEWIKNNNQLYSQSHDDKLKKEQVINLNVLNALLIEWTSTSEGKAISHVRSLKG 720 KPMLFNVIIKKGEKVIMKNQIKILSSLSIGEIKKSIEKEFKIDVDKSTIEIDGVDDFDETTSISDLLLQNESEIILKMAK 800 EESDGSLFRSNELPSSQYYKKEIRMEDVKTLVEMTGVSKQIAYCALKKYLYYSNAVDLAFSALFDDIESITAAYTKDLEN 880 GEIYDIPDDEEVPKEEVDLSFIRLVSDSDEILIIVECLKKHFGEEVEKIVWKIMMSLPSFSGVMKKVNSCFVMNESYGPK 960 GVFDLLTEQSDYTLLYTLQLVDKILFPEKDNESSTTTDTIKSQTLLREIIVKSQPIFDQICLAFRSVLRRESNLIVDIIE 1040 TFSKIFSFFIHKLCKHQQLTFDVTENYELFDECFDIILKNPNNPHISGVFISISSSICELRNKGSSIIVVPDLHEFLIQY 1120 FNSQQKYDEEQVITGSFITSLVNLYQSNSILLYDQTQKLIKDLFNALELYGTKRAMYFYTKTICLLIKSIKENVIDFQEV 1200 FDYVIQKICTIEPNEQFTDDSDYYITGLLKIANLLLPKVEIVPEKISLTVSKLFNNCYGNPLKYKLKSVRNSSYDLINNI 1280 FQICSNLINTFSTEVFDKCFQYKIIKKLDIVPKSSRTGYRGIRNIGSTCYINSVLQQLFMMKEFREKILRLVSTDTMKVT 1360 KQLQKLFISLKGGSQDCYNADLLIDEIQKHKKVYDLKVQQHDACDFLIMLLDCLEDEMNKGSQQQIFPIFTLKTIIQTDS 1440 LDSAIKENRETKEEFRTLPLPIQGKRNVEQCLSNFFKPEFFKGDNRLRTDDGRYFNAVKQYKIESLPHYLFLQLNRFDSF 1520 DVNVMKINDKCEIPLTLDLNKYMKNKNLNGEYCLNGVVIHTGNAGYGHYFSYILNDRKWIEFNDSRVSYISGDMATRNMN 1600 GGYKDFGGYLLVYEKKNYQEEQSRDQVGEDILKELKIEEEKISNDVMYHDNQCLKLILKQSKSFDPIIMKKTIIYCFRYS 1680 FSLLGEGEQNNGLVDEVIEGVKNYNNPEIGKKVLEDVIQNDFVSLYCINSLESIRTRASELIVTAIRWVAESDSVNLFSE 1760 TEILYRFYQSLKSLLMFSRLYPKNLKQYFILFDALASIGPQACYSLSKMGLVKSFWYYFLNKNEDTEESVSAIVLDVFPD 1840 LKYFVTTLQKVICSCYTDDHDEQITPFSNTQNSEYLDNSYSKYKNLIFSGDLLLQLIAYNYDSGCILLKHISYNNFDASL 1920 NIINQFKDCIQSRKQEKSLLKKFNNCSPSSKMKLSFAIRMSKKLPYVKQMLLENTMVLEKMINYLNQFFRCNYQIYNENL 2000 YEQDFIGYGKYIIQNVTEKIKQEPEFQELTYLLELVNERSSMSFDIDALEQEIKETKEELKPLKENQPRSSIPTKVVSDY 2080 LN 2160 ................................................................................ 80 ................................................................................ 160 ................................................................................ 240 ................................................................................ 320 ................................................................................ 400 ................................................................................ 480 ................................................................................ 560 ................................................................................ 640 ................................................................................ 720 ................................................................................ 800 ................................................................................ 880 ................................................................................ 960 ................................................................................ 1040 ................................................................................ 1120 ................................................................................ 1200 ................................................................................ 1280 ................................................................................ 1360 ................................................................................ 1440 ................................................................................ 1520 ................................................................................ 1600 ................................................................................ 1680 ................................................................................ 1760 ................................................................................ 1840 ................................................................................ 1920 ................................................................................ 2000 ................................................................................ 2080 .. 2160 Propeptide cleavage sites predicted: Arg(R)/Lys(K): 0 Name Pos Context Score Pred ____________________________v_________________ EDI_315480 5 --MTEEK|DF 0.061 . EDI_315480 8 TEEKDFK|VF 0.064 . EDI_315480 17 DVENENK|KN 0.067 . EDI_315480 18 VENENKK|NQ 0.096 . EDI_315480 32 FNEYESK|LS 0.073 . EDI_315480 50 IMLSSTK|EK 0.064 . EDI_315480 52 LSSTKEK|DT 0.129 . EDI_315480 58 KDTDIEK|MN 0.061 . EDI_315480 64 KMNHIVK|EI 0.073 . EDI_315480 76 NYFCYIR|SE 0.093 . EDI_315480 81 IRSEYEK|FL 0.080 . EDI_315480 92 FTTTNMK|RL 0.059 . EDI_315480 93 TTTNMKR|LS 0.186 . EDI_315480 100 LSDQFCK|EF 0.063 . EDI_315480 105 CKEFFNK|NI 0.068 . EDI_315480 108 FFNKNIK|VF 0.062 . EDI_315480 113 IKVFFNK|IK 0.066 . EDI_315480 115 VFFNKIK|KE 0.062 . EDI_315480 116 FFNKIKK|ET 0.098 . EDI_315480 126 YTELILK|FM 0.058 . EDI_315480 138 LNLFFSR|IE 0.079 . EDI_315480 148 VDEEGWK|LF 0.070 . EDI_315480 160 FSCEEFK|KT 0.066 . EDI_315480 161 SCEEFKK|TR 0.093 . EDI_315480 163 EEFKKTR|SV 0.285 . EDI_315480 172 YNIETTK|YV 0.084 . EDI_315480 189 FIIEINK|ID 0.056 . EDI_315480 201 NIYEMIR|LY 0.080 . EDI_315480 206 IRLYDLK|LL 0.069 . EDI_315480 231 YLIEEQR|TE 0.071 . 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EDI_315480 525 INEIFMK|VI 0.080 . EDI_315480 538 QMECTTR|RK 0.073 . EDI_315480 539 MECTTRR|KA 0.172 . EDI_315480 540 ECTTRRK|AI 0.073 . EDI_315480 582 NIVQEFK|SQ 0.065 . EDI_315480 595 FINFFSK|DS 0.098 . EDI_315480 600 SKDSDAK|EE 0.062 . EDI_315480 605 AKEEVNK|EV 0.073 . EDI_315480 610 NKEVLIK|NG 0.066 . EDI_315480 616 KNGEGYK|FN 0.069 . EDI_315480 631 AHLIPLK|RL 0.056 . EDI_315480 632 HLIPLKR|LL 0.139 . EDI_315480 640 LIITNNK|VT 0.062 . EDI_315480 645 NKVTEEK|AM 0.061 . EDI_315480 655 LLIAIVK|SV 0.099 . EDI_315480 664 PVQFGWK|VV 0.065 . EDI_315480 671 VVIEWIK|NN 0.062 . EDI_315480 684 SQSHDDK|LK 0.069 . EDI_315480 686 SHDDKLK|KE 0.062 . EDI_315480 687 HDDKLKK|EQ 0.091 . EDI_315480 710 TSTSEGK|AI 0.087 . EDI_315480 716 KAISHVR|SL 0.172 . EDI_315480 719 SHVRSLK|GK 0.122 . EDI_315480 721 VRSLKGK|PM 0.071 . EDI_315480 730 LFNVIIK|KG 0.071 . EDI_315480 731 FNVIIKK|GE 0.092 . EDI_315480 734 IIKKGEK|VI 0.059 . EDI_315480 738 GEKVIMK|NQ 0.074 . EDI_315480 742 IMKNQIK|IL 0.063 . EDI_315480 753 LSIGEIK|KS 0.066 . EDI_315480 754 SIGEIKK|SI 0.233 . EDI_315480 758 IKKSIEK|EF 0.056 . EDI_315480 761 SIEKEFK|ID 0.061 . EDI_315480 766 FKIDVDK|ST 0.085 . EDI_315480 797 ESEIILK|MA 0.065 . EDI_315480 800 IILKMAK|EE 0.061 . EDI_315480 809 SDGSLFR|SN 0.116 . EDI_315480 820 PSSQYYK|KE 0.077 . EDI_315480 821 SSQYYKK|EI 0.116 . EDI_315480 824 YYKKEIR|ME 0.081 . EDI_315480 829 IRMEDVK|TL 0.063 . EDI_315480 839 EMTGVSK|QI 0.057 . EDI_315480 847 IAYCALK|KY 0.054 . EDI_315480 848 AYCALKK|YL 0.090 . EDI_315480 876 ITAAYTK|DL 0.095 . EDI_315480 894 DDEEVPK|EE 0.058 . EDI_315480 903 VDLSFIR|LV 0.111 . EDI_315480 919 IIVECLK|KH 0.060 . EDI_315480 920 IVECLKK|HF 0.097 . EDI_315480 928 FGEEVEK|IV 0.084 . EDI_315480 932 VEKIVWK|IM 0.060 . EDI_315480 945 SFSGVMK|KV 0.097 . EDI_315480 946 FSGVMKK|VN 0.111 . EDI_315480 960 NESYGPK|GV 0.107 . EDI_315480 983 TLQLVDK|IL 0.074 . EDI_315480 989 KILFPEK|DN 0.074 . EDI_315480 1001 TTTDTIK|SQ 0.070 . EDI_315480 1007 KSQTLLR|EI 0.082 . 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Dinesh Gupta lab Translational bioinformatics group, ICGEB, New Delhi, India