EHI_043740 | ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein

_IDPredictionOTHERSPmTPCS_Position
EHI_043740OTHER0.7961430.2036800.000178
No Results

  • Fasta :-

    >EHI_043740 MTSNDVFIKMLPLLIFIPDYICNVNYSLNYPTLKIKDIPLNPFSPVSLLPVNLSLPLTPN SFFLPFYKNFEVNCHPLYSSPVSYKFSEDFIQKLNEINHPYALQLLLHIKSTEPKTLLHP LLKCLIQYENQTLQNNTLSIEPNCLQSDELLENLTEQIYILPFNNLNISLPSNNINNLTF NESYQIYVLLLKQQPEHCLSIIRQLVNIIGNPFSSGIVQSLPDEFKPTISQVIIESIPSH PLMSNYFEESLQYLQTISKKTNLLPSLIYVLNSLNTLTKEELMKREELIVDFIEYCLNHI TNLSEQLKLAFTEGCSNFIRVLYDFDDLTLPIAKETSLRYRIIDILTQIIQIYPNVITSL SITFKNCIEPLNYTPYNPLSYGIFSNSGSSTPSRSVSRSDLYSTISRSGSLNFNESYCES KSRNSKSKSESSKSLKRSGRKNNNIETVKIGNIIGIRNLGSTCYLNSILQQLYGDVYFRN SMLLIDSIKPEQPFLSSLRDLFIKLMRSSIVIDPRTEVSEMRNKKYGIIKPGVQRDACEM LMEILDSVSDELKGNLGINALKKSYLIEALTEIRSCDCSHNQQRVEEHVVLPLEIKGLKN LEESLEILTGTEYIGDKQYKCEECHKQINIKKQMFLHQLPNTLIFQLKRFDFNLQTFQQE KINSRFLFPDYINLRPFTFTKIKDEEYCLAGVIVHSGNCTGGHYTSYIKDGSKWFLCNDE QVIEVKREYAEMEWFGTKNKSGYLLFYRRITPLEEIPSISIKTTTVPIEKEQKSSKKNKK GKSKKGYETKFEIIKDGEKKNGNSCLSSTLTSSISESTQSSSIDLNEEINEFEQQESIYT EQYLFDENIFYSFLLELYQHIEICTKETVSFIIQIIMFSLNERRNEDFCEERKQLLNYVL ENPCQIVAESLIENEINNKVIMTKRYCFNPRSTSSKYTSYVIDCLKLCSIEINQRYLYQL FVFYSTLTLTKAHVHGIKTLFGNGLRLLTDLSSLKCSIDNAVMKQLFLSIKQSDFILXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLKQNIILTYKNH
  • Download Fasta
  • MitoProt II - v1.101 File : /home/rajan/sadaf/4480_mitoprot/test/EHI_043740.fa Sequence name : EHI_043740 Sequence length : 1063 VALUES OF COMPUTED PARAMETERS Coef20 : 3.841 CoefTot : -4.229 ChDiff : -5 ZoneTo : 87 KR : 5 DE : 4 CleavSite : 0 HYDROPHOBIC SCALE USED GES KD GVH1 ECS H17 : 1.194 1.865 0.158 0.672 MesoH : 0.054 0.556 -0.254 0.341 MuHd_075 : 37.201 22.822 10.408 7.523 MuHd_095 : 27.320 22.088 8.282 6.054 MuHd_100 : 32.880 22.062 8.944 5.853 MuHd_105 : 33.271 25.977 9.442 7.677 Hmax_075 : 19.250 21.583 4.097 7.840 Hmax_095 : 11.900 13.400 2.265 5.330 Hmax_100 : 21.500 23.300 4.970 7.940 Hmax_105 : 22.050 22.300 5.706 7.720 CLASS NOT-MITO MITO(/CHLORO) DFM : 0.9928 0.0072 DFMC : 0.9948 0.0052
  • ##### ProP v.1.0b ProPeptide Cleavage Site Prediction ##### ##### Furin-type cleavage site prediction (Arginine/Lysine residues) ##### 1063 EHI_043740 MTSNDVFIKMLPLLIFIPDYICNVNYSLNYPTLKIKDIPLNPFSPVSLLPVNLSLPLTPNSFFLPFYKNFEVNCHPLYSS 80 PVSYKFSEDFIQKLNEINHPYALQLLLHIKSTEPKTLLHPLLKCLIQYENQTLQNNTLSIEPNCLQSDELLENLTEQIYI 160 LPFNNLNISLPSNNINNLTFNESYQIYVLLLKQQPEHCLSIIRQLVNIIGNPFSSGIVQSLPDEFKPTISQVIIESIPSH 240 PLMSNYFEESLQYLQTISKKTNLLPSLIYVLNSLNTLTKEELMKREELIVDFIEYCLNHITNLSEQLKLAFTEGCSNFIR 320 VLYDFDDLTLPIAKETSLRYRIIDILTQIIQIYPNVITSLSITFKNCIEPLNYTPYNPLSYGIFSNSGSSTPSRSVSRSD 400 LYSTISRSGSLNFNESYCESKSRNSKSKSESSKSLKRSGRKNNNIETVKIGNIIGIRNLGSTCYLNSILQQLYGDVYFRN 480 SMLLIDSIKPEQPFLSSLRDLFIKLMRSSIVIDPRTEVSEMRNKKYGIIKPGVQRDACEMLMEILDSVSDELKGNLGINA 560 LKKSYLIEALTEIRSCDCSHNQQRVEEHVVLPLEIKGLKNLEESLEILTGTEYIGDKQYKCEECHKQINIKKQMFLHQLP 640 NTLIFQLKRFDFNLQTFQQEKINSRFLFPDYINLRPFTFTKIKDEEYCLAGVIVHSGNCTGGHYTSYIKDGSKWFLCNDE 720 QVIEVKREYAEMEWFGTKNKSGYLLFYRRITPLEEIPSISIKTTTVPIEKEQKSSKKNKKGKSKKGYETKFEIIKDGEKK 800 NGNSCLSSTLTSSISESTQSSSIDLNEEINEFEQQESIYTEQYLFDENIFYSFLLELYQHIEICTKETVSFIIQIIMFSL 880 NERRNEDFCEERKQLLNYVLENPCQIVAESLIENEINNKVIMTKRYCFNPRSTSSKYTSYVIDCLKLCSIEINQRYLYQL 960 FVFYSTLTLTKAHVHGIKTLFGNGLRLLTDLSSLKCSIDNAVMKQLFLSIKQSDFILXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX 1040 XXXXXXXXXXXLKQNIILTYKNH 1120 ................................................................................ 80 ................................................................................ 160 ................................................................................ 240 ................................................................................ 320 ................................................................................ 400 ................................................................................ 480 ................................................................................ 560 ................................................................................ 640 ................................................................................ 720 ................................................................................ 800 ................................................................................ 880 ................................................................................ 960 ................................................................................ 1040 ....................... 1120 Propeptide cleavage sites predicted: Arg(R)/Lys(K): 0 Name Pos Context Score Pred ____________________________v_________________ EHI_043740 9 SNDVFIK|ML 0.063 . EHI_043740 34 LNYPTLK|IK 0.064 . EHI_043740 36 YPTLKIK|DI 0.069 . EHI_043740 68 FFLPFYK|NF 0.059 . EHI_043740 85 SSPVSYK|FS 0.084 . EHI_043740 93 SEDFIQK|LN 0.061 . EHI_043740 110 QLLLHIK|ST 0.088 . EHI_043740 115 IKSTEPK|TL 0.068 . EHI_043740 123 LLHPLLK|CL 0.082 . EHI_043740 192 IYVLLLK|QQ 0.052 . EHI_043740 203 HCLSIIR|QL 0.078 . EHI_043740 226 SLPDEFK|PT 0.066 . EHI_043740 259 YLQTISK|KT 0.056 . EHI_043740 260 LQTISKK|TN 0.067 . EHI_043740 279 SLNTLTK|EE 0.062 . EHI_043740 284 TKEELMK|RE 0.068 . EHI_043740 285 KEELMKR|EE 0.114 . EHI_043740 308 NLSEQLK|LA 0.083 . EHI_043740 320 GCSNFIR|VL 0.103 . EHI_043740 334 LTLPIAK|ET 0.059 . EHI_043740 339 AKETSLR|YR 0.088 . EHI_043740 341 ETSLRYR|II 0.121 . EHI_043740 365 SLSITFK|NC 0.073 . EHI_043740 394 GSSTPSR|SV 0.359 . EHI_043740 398 PSRSVSR|SD 0.116 . EHI_043740 407 LYSTISR|SG 0.122 . EHI_043740 421 ESYCESK|SR 0.073 . EHI_043740 423 YCESKSR|NS 0.083 . EHI_043740 426 SKSRNSK|SK 0.348 . EHI_043740 428 SRNSKSK|SE 0.108 . EHI_043740 433 SKSESSK|SL 0.124 . EHI_043740 436 ESSKSLK|RS 0.081 . EHI_043740 437 SSKSLKR|SG 0.278 . EHI_043740 440 SLKRSGR|KN 0.346 . EHI_043740 441 LKRSGRK|NN 0.078 . EHI_043740 449 NNIETVK|IG 0.059 . EHI_043740 457 GNIIGIR|NL 0.076 . EHI_043740 479 YGDVYFR|NS 0.075 . EHI_043740 489 LLIDSIK|PE 0.065 . EHI_043740 499 PFLSSLR|DL 0.105 . EHI_043740 504 LRDLFIK|LM 0.063 . EHI_043740 507 LFIKLMR|SS 0.119 . EHI_043740 515 SIVIDPR|TE 0.076 . EHI_043740 522 TEVSEMR|NK 0.088 . EHI_043740 524 VSEMRNK|KY 0.073 . EHI_043740 525 SEMRNKK|YG 0.347 . EHI_043740 530 KKYGIIK|PG 0.062 . EHI_043740 535 IKPGVQR|DA 0.150 . EHI_043740 553 SVSDELK|GN 0.066 . EHI_043740 562 LGINALK|KS 0.060 . EHI_043740 563 GINALKK|SY 0.169 . EHI_043740 574 EALTEIR|SC 0.105 . EHI_043740 584 CSHNQQR|VE 0.103 . EHI_043740 596 VLPLEIK|GL 0.064 . EHI_043740 599 LEIKGLK|NL 0.065 . EHI_043740 617 TEYIGDK|QY 0.066 . EHI_043740 620 IGDKQYK|CE 0.066 . EHI_043740 626 KCEECHK|QI 0.071 . EHI_043740 631 HKQINIK|KQ 0.060 . EHI_043740 632 KQINIKK|QM 0.090 . EHI_043740 648 TLIFQLK|RF 0.076 . EHI_043740 649 LIFQLKR|FD 0.163 . EHI_043740 661 QTFQQEK|IN 0.064 . EHI_043740 665 QEKINSR|FL 0.090 . EHI_043740 675 PDYINLR|PF 0.068 . EHI_043740 681 RPFTFTK|IK 0.069 . EHI_043740 683 FTFTKIK|DE 0.076 . EHI_043740 709 HYTSYIK|DG 0.060 . EHI_043740 713 YIKDGSK|WF 0.057 . EHI_043740 726 EQVIEVK|RE 0.065 . EHI_043740 727 QVIEVKR|EY 0.153 . EHI_043740 738 MEWFGTK|NK 0.065 . EHI_043740 740 WFGTKNK|SG 0.065 . EHI_043740 748 GYLLFYR|RI 0.085 . EHI_043740 749 YLLFYRR|IT 0.095 . EHI_043740 762 IPSISIK|TT 0.076 . EHI_043740 770 TTVPIEK|EQ 0.056 . EHI_043740 773 PIEKEQK|SS 0.074 . EHI_043740 776 KEQKSSK|KN 0.069 . EHI_043740 777 EQKSSKK|NK 0.090 . EHI_043740 779 KSSKKNK|KG 0.083 . EHI_043740 780 SSKKNKK|GK 0.196 . EHI_043740 782 KKNKKGK|SK 0.170 . EHI_043740 784 NKKGKSK|KG 0.064 . EHI_043740 785 KKGKSKK|GY 0.238 . EHI_043740 790 KKGYETK|FE 0.073 . EHI_043740 795 TKFEIIK|DG 0.076 . EHI_043740 799 IIKDGEK|KN 0.060 . EHI_043740 800 IKDGEKK|NG 0.094 . EHI_043740 866 HIEICTK|ET 0.059 . EHI_043740 883 MFSLNER|RN 0.084 . EHI_043740 884 FSLNERR|NE 0.108 . EHI_043740 892 EDFCEER|KQ 0.062 . EHI_043740 893 DFCEERK|QL 0.065 . EHI_043740 919 ENEINNK|VI 0.061 . EHI_043740 924 NKVIMTK|RY 0.063 . EHI_043740 925 KVIMTKR|YC 0.190 . EHI_043740 931 RYCFNPR|ST 0.183 . EHI_043740 936 PRSTSSK|YT 0.151 . EHI_043740 946 YVIDCLK|LC 0.062 . EHI_043740 955 SIEINQR|YL 0.088 . EHI_043740 971 STLTLTK|AH 0.062 . EHI_043740 978 AHVHGIK|TL 0.063 . EHI_043740 986 LFGNGLR|LL 0.067 . EHI_043740 995 TDLSSLK|CS 0.060 . EHI_043740 1004 IDNAVMK|QL 0.086 . EHI_043740 1011 QLFLSIK|QS 0.075 . EHI_043740 1053 XXXXXLK|QN 0.063 . EHI_043740 1061 NIILTYK|NH 0.058 . ____________________________^_________________

  • Fasta :-

    >EHI_043740 ATGACATCAAATGATGTATTTATTAAAATGCTTCCGTTGTTAATTTTCATTCCTGATTAT ATTTGTAACGTTAATTATTCATTAAATTATCCAACTCTCAAAATAAAGGATATTCCATTA AACCCATTTTCTCCAGTATCGTTGTTACCTGTCAATTTATCACTTCCATTAACACCAAAC TCATTTTTTCTTCCATTTTATAAAAATTTTGAAGTTAATTGTCATCCTTTATATTCTTCA CCAGTTTCATATAAATTTTCAGAAGATTTTATTCAAAAATTAAATGAAATTAATCACCCA TATGCATTACAATTACTTCTCCATATTAAATCAACTGAACCTAAAACCTTACTTCATCCA CTGTTAAAATGTTTAATTCAATATGAAAATCAAACACTTCAAAATAACACTCTTTCTATT GAACCTAATTGTTTACAATCAGATGAATTACTAGAAAATTTAACAGAACAAATTTATATA CTTCCATTTAATAATTTAAATATTTCATTACCATCAAATAATATAAACAATTTAACATTT AATGAATCTTATCAAATATATGTGTTATTATTAAAACAACAACCTGAACATTGTCTATCA ATAATAAGACAATTAGTTAATATTATTGGAAATCCATTCAGTTCTGGAATTGTGCAATCA TTGCCTGATGAATTTAAGCCAACTATTAGTCAAGTAATTATTGAATCAATACCTTCTCAT CCTTTAATGTCAAATTATTTTGAAGAATCATTACAATATTTACAAACGATATCAAAAAAA ACTAATTTATTACCATCATTAATTTATGTACTTAATTCATTAAATACATTAACTAAAGAA GAATTAATGAAAAGAGAAGAGTTAATTGTTGACTTTATAGAGTATTGTTTAAATCACATT ACAAATTTATCTGAACAATTAAAATTAGCATTTACTGAAGGATGTTCCAATTTCATTAGA GTGTTATATGATTTTGATGATTTAACACTTCCAATAGCAAAAGAAACCAGTTTAAGGTAT CGAATTATTGATATACTAACTCAAATTATTCAAATTTATCCAAATGTAATAACATCTCTT AGTATTACATTCAAAAATTGTATTGAACCATTAAATTATACTCCATACAATCCACTTAGT TATGGAATATTTTCTAATAGTGGAAGTTCAACACCAAGTAGATCAGTTAGTAGATCAGAT TTATATTCTACTATTTCAAGGAGTGGAAGTTTAAATTTTAATGAAAGTTATTGTGAAAGT AAAAGCAGAAACTCTAAAAGTAAAAGTGAATCTTCTAAATCATTAAAAAGAAGTGGTAGA AAGAATAACAATATTGAAACAGTAAAAATTGGAAATATCATTGGAATAAGAAACCTTGGT AGTACGTGTTATTTAAACTCTATTCTACAACAATTATATGGAGATGTTTATTTTAGAAAT TCAATGCTTCTCATAGATTCAATTAAACCTGAACAACCATTTTTAAGTTCATTAAGAGAT TTATTTATTAAATTAATGAGGTCAAGTATTGTTATTGATCCAAGAACCGAAGTTAGTGAA ATGAGAAATAAAAAATATGGAATAATTAAGCCAGGTGTTCAAAGAGATGCATGTGAAATG TTAATGGAAATACTTGACTCAGTAAGTGATGAATTAAAAGGAAATCTTGGAATTAATGCA TTAAAAAAATCATATTTAATTGAAGCATTAACAGAAATAAGATCATGTGATTGTTCACAT AATCAACAAAGAGTTGAAGAACATGTAGTGTTACCATTAGAAATTAAAGGATTAAAAAAT TTAGAAGAGTCATTAGAAATATTAACAGGTACTGAATATATTGGAGATAAACAATATAAA TGTGAAGAATGTCATAAACAAATTAATATTAAAAAGCAAATGTTTCTTCATCAATTACCA AATACATTAATATTTCAATTAAAAAGATTTGATTTTAACCTTCAAACATTTCAACAAGAA AAAATTAATTCTCGTTTTCTATTTCCTGATTATATTAATTTAAGACCTTTTACATTTACT AAAATTAAAGATGAAGAGTATTGTCTTGCTGGAGTTATTGTTCATTCAGGAAACTGTACT GGAGGACATTACACATCATATATTAAAGATGGAAGTAAATGGTTTTTATGTAATGATGAA CAAGTTATTGAAGTAAAAAGAGAGTATGCAGAAATGGAATGGTTTGGAACAAAAAATAAA TCAGGATATCTTCTTTTTTATCGTAGAATTACTCCTCTTGAAGAAATTCCATCAATTTCA ATTAAAACAACAACAGTTCCAATTGAAAAAGAACAAAAATCTTCAAAAAAGAATAAAAAA GGAAAATCAAAAAAAGGATATGAAACGAAATTTGAAATTATTAAAGACGGAGAAAAGAAA AATGGAAATAGTTGTTTATCATCAACTTTAACTTCTTCAATTTCAGAATCTACACAAAGT TCTTCAATTGATTTAAATGAAGAAATCAATGAATTTGAACAACAAGAGAGTATTTATACA GAACAATATTTATTTGATGAAAACATATTTTATTCATTTTTACTAGAATTATATCAACAT ATAGAAATTTGTACAAAAGAAACTGTTTCATTTATTATTCAAATTATTATGTTTAGTTTA AATGAACGTAGAAATGAAGATTTTTGTGAAGAAAGAAAACAATTATTAAATTATGTATTA GAAAATCCTTGTCAAATTGTAGCTGAGTCATTAATTGAAAATGAAATTAATAATAAAGTA ATAATGACAAAAAGATATTGTTTCAATCCACGTTCCACTTCATCAAAATATACTTCATAT GTTATTGACTGTTTAAAATTATGTTCAATTGAAATTAATCAACGTTACCTTTATCAATTA TTTGTATTTTATTCAACACTTACATTAACTAAAGCTCATGTCCATGGAATTAAAACATTG TTTGGAAATGGATTAAGATTATTAACTGATTTAAGTTCTTTAAAATGTTCTATTGATAAT GCTGTTATGAAACAGTTATTTTTATCAATTAAACAATCTGATTTTATTTTAGANNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAAACAAAACATCATTTTGACTTAC AAAAATCATTAG
  • Download Fasta

  • Fasta :-

    MTSNDVFIKMLPLLIFIPDYICNVNYSLNYPTLKIKDIPLNPFSPVSLLPVNLSLPLTPN SFFLPFYKNFEVNCHPLYSSPVSYKFSEDFIQKLNEINHPYALQLLLHIKSTEPKTLLHP LLKCLIQYENQTLQNNTLSIEPNCLQSDELLENLTEQIYILPFNNLNISLPSNNINNLTF NESYQIYVLLLKQQPEHCLSIIRQLVNIIGNPFSSGIVQSLPDEFKPTISQVIIESIPSH PLMSNYFEESLQYLQTISKKTNLLPSLIYVLNSLNTLTKEELMKREELIVDFIEYCLNHI TNLSEQLKLAFTEGCSNFIRVLYDFDDLTLPIAKETSLRYRIIDILTQIIQIYPNVITSL SITFKNCIEPLNYTPYNPLSYGIFSNSGSSTPSRSVSRSDLYSTISRSGSLNFNESYCES KSRNSKSKSESSKSLKRSGRKNNNIETVKIGNIIGIRNLGSTCYLNSILQQLYGDVYFRN SMLLIDSIKPEQPFLSSLRDLFIKLMRSSIVIDPRTEVSEMRNKKYGIIKPGVQRDACEM LMEILDSVSDELKGNLGINALKKSYLIEALTEIRSCDCSHNQQRVEEHVVLPLEIKGLKN LEESLEILTGTEYIGDKQYKCEECHKQINIKKQMFLHQLPNTLIFQLKRFDFNLQTFQQE KINSRFLFPDYINLRPFTFTKIKDEEYCLAGVIVHSGNCTGGHYTSYIKDGSKWFLCNDE QVIEVKREYAEMEWFGTKNKSGYLLFYRRITPLEEIPSISIKTTTVPIEKEQKSSKKNKK GKSKKGYETKFEIIKDGEKKNGNSCLSSTLTSSISESTQSSSIDLNEEINEFEQQESIYT EQYLFDENIFYSFLLELYQHIEICTKETVSFIIQIIMFSLNERRNEDFCEERKQLLNYVL ENPCQIVAESLIENEINNKVIMTKRYCFNPRSTSSKYTSYVIDCLKLCSIEINQRYLYQL FVFYSTLTLTKAHVHGIKTLFGNGLRLLTDLSSLKCSIDNAVMKQLFLSIKQSDFILXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLKQNIILTYKNH

  • title: Active Site
  • coordinates: N458,C463,H703,D719
No Results
No Results
IDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethod
EHI_043740397 SSRSVSRSDL0.998unspEHI_043740397 SSRSVSRSDL0.998unspEHI_043740397 SSRSVSRSDL0.998unspEHI_043740425 SKSRNSKSKS0.997unspEHI_043740427 SRNSKSKSES0.995unspEHI_043740431 SSKSESSKSL0.997unspEHI_043740434 SESSKSLKRS0.997unspEHI_043740547 SEILDSVSDE0.992unspEHI_043740751 TYRRITPLEE0.993unspEHI_043740774 SKEQKSSKKN0.996unspEHI_043740775 SEQKSSKKNK0.995unspEHI_043740783 SKKGKSKKGY0.995unspEHI_043740934 SPRSTSSKYT0.993unspEHI_04374083 SSSPVSYKFS0.997unspEHI_043740395 STPSRSVSRS0.995unsp

EHI_043740      



Dinesh Gupta lab Translational bioinformatics group, ICGEB, New Delhi, India