LmjF.09.0240 | cysteine peptidase, Clan CA, family C19, putative

_IDPredictionOTHERSPmTPCS_Position
LmjF.09.0240SP0.4292620.5582850.012453CS pos: 28-29. ASS-RR. Pr: 0.3041
No Results

  • Fasta :-

    >LmjF.09.0240 MHLRVLPRCRRTTTSYLLLIMSATAASSRRKQHYESLKEESMIPFEMELDEAIELPFDVN AVAPTDVALSAPFGGKKIPMRAARAASESRVAWSNGSTASVGFAVCGNGKELPSTAATAD GVASPIATPANAAPTTYSAAAPSRMLTWKDTSASQRRAEAQASRQDDFHPMVLCPLQNLG NTCYFNAGVQLLVNCPALVYAVRNSPFARWTRSNGPLTAQAVPMPRAEAAPAATKLCLKG GAAIHTLFQEFSILLARMEMGCAAGERAISPICALDSLAQAYPQFEGRSQQDAAEMMTSL LASLEEEGGQYVEVAQLLQSFEDAAALRQGVTPLASSPRASDPVTRALKGATSPLLEAET APSASPHRRNYSEPCNIEEYSQSSLLSSTSEDTFLPGPRSAHFFNVLRLMERVNRENELL ERRVKQRQGIAYTNSFKPPRLHFNPLLDGFRGYTLSEVECHNCRAVSRVVSPFNGLLLDV PTAKQRRRYALAHPNVPRRVDFDGQLRQVKKPFRLTWWNPLSLCVAAWRQLKQFFQDPFP YPLWLDECLDIHFEPEVLRGCSRYRCESCDTTTDATKSETLLALPEYLLIYMKRFEAGRF FNSKKSDSVFFPTSWRPLTTTQARQSPINTDDAPPALPEYLDLRHYLHSSVAPFAEPIPP CLWGTDNEPHQQHHVSRDDASTPTSSIATTYTLDGIVNHHGGYDGGHYTVFLYKATEERQ AWVYISDDEVEQAEEVVATDTEYVLLYRRQPLVQAAPESDEAEQLRRKACYYLSQSSPSC PAPNAAAATTDGPKASKPHSSCPFSSSSAGGVASTPPHAATAATEPWVYISRMWLQRVAF MHEPGPIVNRLCYCRPEDRGRVSMYQSIFPATVKVPAEVPHVHGPPVSWFYAPITQRDYD IFYNAFGGNLAVTASEYESLRAMQDKFCAAIDLAERQRGSAARPAPRH
  • Download Fasta
  • MitoProt II - v1.101 File : /home/rajan/sadaf/4480_mitoprot/test/321 Sequence name : 321 Sequence length : 948 VALUES OF COMPUTED PARAMETERS Coef20 : 5.042 CoefTot : 0.978 ChDiff : -5 ZoneTo : 34 KR : 7 DE : 0 CleavSite : 14 HYDROPHOBIC SCALE USED GES KD GVH1 ECS H17 : 1.541 1.312 0.152 0.535 MesoH : -0.038 0.458 -0.242 0.225 MuHd_075 : 21.069 8.881 5.419 3.593 MuHd_095 : 33.077 20.243 8.517 7.492 MuHd_100 : 34.381 19.895 9.420 8.233 MuHd_105 : 36.417 19.707 9.587 8.641 Hmax_075 : 13.533 15.050 3.678 3.512 Hmax_095 : 15.050 16.363 3.860 5.110 Hmax_100 : 13.800 16.800 4.275 5.200 Hmax_105 : 14.000 16.400 4.177 5.200 CLASS NOT-MITO MITO(/CHLORO) DFM : 0.0689 0.9311 DFMC : 0.0337 0.9663 This protein is probably imported in mitochondria. f(Ser) = 0.1176 f(Arg) = 0.1765 CMi = 0.37106 CMi is the Chloroplast/Mitochondria Index It has been proposed by Von Heijne et al (Eur J Biochem,1989, 180: 535-545)
  • ##### ProP v.1.0b ProPeptide Cleavage Site Prediction ##### ##### Furin-type cleavage site prediction (Arginine/Lysine residues) ##### 948 LmjF.09.0240 MHLRVLPRCRRTTTSYLLLIMSATAASSRRKQHYESLKEESMIPFEMELDEAIELPFDVNAVAPTDVALSAPFGGKKIPM 80 RAARAASESRVAWSNGSTASVGFAVCGNGKELPSTAATADGVASPIATPANAAPTTYSAAAPSRMLTWKDTSASQRRAEA 160 QASRQDDFHPMVLCPLQNLGNTCYFNAGVQLLVNCPALVYAVRNSPFARWTRSNGPLTAQAVPMPRAEAAPAATKLCLKG 240 GAAIHTLFQEFSILLARMEMGCAAGERAISPICALDSLAQAYPQFEGRSQQDAAEMMTSLLASLEEEGGQYVEVAQLLQS 320 FEDAAALRQGVTPLASSPRASDPVTRALKGATSPLLEAETAPSASPHRRNYSEPCNIEEYSQSSLLSSTSEDTFLPGPRS 400 AHFFNVLRLMERVNRENELLERRVKQRQGIAYTNSFKPPRLHFNPLLDGFRGYTLSEVECHNCRAVSRVVSPFNGLLLDV 480 PTAKQRRRYALAHPNVPRRVDFDGQLRQVKKPFRLTWWNPLSLCVAAWRQLKQFFQDPFPYPLWLDECLDIHFEPEVLRG 560 CSRYRCESCDTTTDATKSETLLALPEYLLIYMKRFEAGRFFNSKKSDSVFFPTSWRPLTTTQARQSPINTDDAPPALPEY 640 LDLRHYLHSSVAPFAEPIPPCLWGTDNEPHQQHHVSRDDASTPTSSIATTYTLDGIVNHHGGYDGGHYTVFLYKATEERQ 720 AWVYISDDEVEQAEEVVATDTEYVLLYRRQPLVQAAPESDEAEQLRRKACYYLSQSSPSCPAPNAAAATTDGPKASKPHS 800 SCPFSSSSAGGVASTPPHAATAATEPWVYISRMWLQRVAFMHEPGPIVNRLCYCRPEDRGRVSMYQSIFPATVKVPAEVP 880 HVHGPPVSWFYAPITQRDYDIFYNAFGGNLAVTASEYESLRAMQDKFCAAIDLAERQRGSAARPAPRH 960 ................................................................................ 80 ...P............................................................................ 160 ...................................................P............................ 240 ................................................................................ 320 ................................................................................ 400 ................................................................................ 480 ................................................................................ 560 ................................................................................ 640 ................................................................................ 720 ................................................................................ 800 ................................................................................ 880 .................................................................... 960 Propeptide cleavage sites predicted: Arg(R)/Lys(K): 2 Name Pos Context Score Pred ____________________________v_________________ LmjF.09.0240 4 ---MHLR|VL 0.088 . LmjF.09.0240 8 HLRVLPR|CR 0.091 . LmjF.09.0240 10 RVLPRCR|RT 0.080 . LmjF.09.0240 11 VLPRCRR|TT 0.292 . LmjF.09.0240 29 ATAASSR|RK 0.087 . LmjF.09.0240 30 TAASSRR|KQ 0.147 . LmjF.09.0240 31 AASSRRK|QH 0.107 . LmjF.09.0240 38 QHYESLK|EE 0.069 . LmjF.09.0240 76 SAPFGGK|KI 0.056 . LmjF.09.0240 77 APFGGKK|IP 0.083 . LmjF.09.0240 81 GKKIPMR|AA 0.138 . LmjF.09.0240 84 IPMRAAR|AA 0.661 *ProP* LmjF.09.0240 90 RAASESR|VA 0.106 . LmjF.09.0240 110 AVCGNGK|EL 0.057 . LmjF.09.0240 144 SAAAPSR|ML 0.125 . LmjF.09.0240 149 SRMLTWK|DT 0.139 . LmjF.09.0240 156 DTSASQR|RA 0.155 . LmjF.09.0240 157 TSASQRR|AE 0.173 . LmjF.09.0240 164 AEAQASR|QD 0.088 . LmjF.09.0240 203 ALVYAVR|NS 0.078 . LmjF.09.0240 209 RNSPFAR|WT 0.181 . LmjF.09.0240 212 PFARWTR|SN 0.512 *ProP* LmjF.09.0240 226 QAVPMPR|AE 0.077 . LmjF.09.0240 235 AAPAATK|LC 0.059 . LmjF.09.0240 239 ATKLCLK|GG 0.061 . LmjF.09.0240 257 FSILLAR|ME 0.085 . LmjF.09.0240 267 GCAAGER|AI 0.116 . LmjF.09.0240 288 YPQFEGR|SQ 0.175 . LmjF.09.0240 328 EDAAALR|QG 0.079 . LmjF.09.0240 339 PLASSPR|AS 0.152 . LmjF.09.0240 346 ASDPVTR|AL 0.100 . LmjF.09.0240 349 PVTRALK|GA 0.102 . LmjF.09.0240 368 PSASPHR|RN 0.082 . LmjF.09.0240 369 SASPHRR|NY 0.244 . LmjF.09.0240 399 TFLPGPR|SA 0.124 . LmjF.09.0240 408 HFFNVLR|LM 0.081 . LmjF.09.0240 412 VLRLMER|VN 0.079 . LmjF.09.0240 415 LMERVNR|EN 0.221 . LmjF.09.0240 422 ENELLER|RV 0.093 . LmjF.09.0240 423 NELLERR|VK 0.093 . LmjF.09.0240 425 LLERRVK|QR 0.111 . LmjF.09.0240 427 ERRVKQR|QG 0.148 . LmjF.09.0240 437 AYTNSFK|PP 0.056 . LmjF.09.0240 440 NSFKPPR|LH 0.084 . LmjF.09.0240 451 PLLDGFR|GY 0.077 . LmjF.09.0240 464 VECHNCR|AV 0.126 . LmjF.09.0240 468 NCRAVSR|VV 0.135 . LmjF.09.0240 484 LDVPTAK|QR 0.062 . LmjF.09.0240 486 VPTAKQR|RR 0.075 . LmjF.09.0240 487 PTAKQRR|RY 0.119 . LmjF.09.0240 488 TAKQRRR|YA 0.231 . LmjF.09.0240 498 AHPNVPR|RV 0.113 . LmjF.09.0240 499 HPNVPRR|VD 0.244 . LmjF.09.0240 507 DFDGQLR|QV 0.087 . LmjF.09.0240 510 GQLRQVK|KP 0.098 . LmjF.09.0240 511 QLRQVKK|PF 0.093 . LmjF.09.0240 514 QVKKPFR|LT 0.088 . LmjF.09.0240 529 LCVAAWR|QL 0.093 . LmjF.09.0240 532 AAWRQLK|QF 0.115 . LmjF.09.0240 559 FEPEVLR|GC 0.093 . LmjF.09.0240 563 VLRGCSR|YR 0.093 . LmjF.09.0240 565 RGCSRYR|CE 0.088 . LmjF.09.0240 577 TTTDATK|SE 0.060 . LmjF.09.0240 593 YLLIYMK|RF 0.062 . LmjF.09.0240 594 LLIYMKR|FE 0.203 . LmjF.09.0240 599 KRFEAGR|FF 0.098 . LmjF.09.0240 604 GRFFNSK|KS 0.074 . LmjF.09.0240 605 RFFNSKK|SD 0.212 . LmjF.09.0240 616 FFPTSWR|PL 0.078 . LmjF.09.0240 624 LTTTQAR|QS 0.088 . LmjF.09.0240 644 PEYLDLR|HY 0.072 . LmjF.09.0240 677 QQHHVSR|DD 0.142 . LmjF.09.0240 714 YTVFLYK|AT 0.074 . LmjF.09.0240 719 YKATEER|QA 0.111 . LmjF.09.0240 748 EYVLLYR|RQ 0.065 . LmjF.09.0240 749 YVLLYRR|QP 0.073 . LmjF.09.0240 766 DEAEQLR|RK 0.076 . LmjF.09.0240 767 EAEQLRR|KA 0.157 . LmjF.09.0240 768 AEQLRRK|AC 0.070 . LmjF.09.0240 794 ATTDGPK|AS 0.057 . LmjF.09.0240 797 DGPKASK|PH 0.061 . LmjF.09.0240 832 PWVYISR|MW 0.081 . LmjF.09.0240 837 SRMWLQR|VA 0.154 . LmjF.09.0240 850 PGPIVNR|LC 0.070 . LmjF.09.0240 855 NRLCYCR|PE 0.101 . LmjF.09.0240 859 YCRPEDR|GR 0.073 . LmjF.09.0240 861 RPEDRGR|VS 0.088 . LmjF.09.0240 874 IFPATVK|VP 0.057 . LmjF.09.0240 897 YAPITQR|DY 0.104 . LmjF.09.0240 921 SEYESLR|AM 0.094 . LmjF.09.0240 926 LRAMQDK|FC 0.098 . LmjF.09.0240 936 AIDLAER|QR 0.071 . LmjF.09.0240 938 DLAERQR|GS 0.082 . LmjF.09.0240 943 QRGSAAR|PA 0.132 . LmjF.09.0240 947 AARPAPR|H- 0.104 . ____________________________^_________________

  • Fasta :-

    >LmjF.09.0240 ATGCACTTGCGCGTGCTGCCACGGTGTCGCCGAACCACCACATCTTACCTGCTGCTCATC ATGTCCGCCACGGCAGCGTCGTCGCGGCGGAAGCAGCACTACGAGTCGCTCAAGGAGGAG TCGATGATCCCGTTCGAGATGGAGCTCGACGAGGCGATCGAGCTGCCGTTCGACGTGAAC GCCGTCGCACCTACAGACGTGGCGCTGAGCGCGCCGTTTGGGGGTAAAAAAATCCCAATG CGTGCTGCAAGGGCCGCTTCAGAGAGCAGGGTTGCATGGAGTAACGGCAGCACCGCCAGC GTCGGATTCGCCGTGTGCGGCAATGGAAAGGAGCTCCCGAGCACCGCCGCAACCGCCGAC GGCGTCGCCTCTCCCATCGCCACGCCAGCCAATGCAGCTCCCACAACCTACTCGGCGGCG GCGCCGTCACGCATGTTGACGTGGAAGGACACCAGCGCATCTCAGCGGCGTGCCGAGGCG CAGGCGAGTCGCCAAGACGACTTCCACCCCATGGTCCTGTGCCCGCTGCAGAACCTGGGC AACACGTGCTACTTCAACGCGGGTGTGCAGCTGCTCGTGAACTGCCCCGCCCTCGTCTAT GCAGTGCGCAATTCGCCGTTTGCGCGGTGGACGCGGAGCAACGGCCCCCTCACCGCCCAG GCCGTACCGATGCCGCGGGCTGAAGCGGCACCGGCAGCGACGAAGCTGTGCCTGAAAGGG GGTGCCGCCATCCACACACTCTTCCAGGAGTTCTCCATCCTGCTCGCCCGCATGGAAATG GGATGTGCAGCCGGTGAGAGGGCGATCTCGCCAATTTGTGCGCTCGACTCCCTCGCGCAG GCGTATCCGCAGTTCGAGGGTCGAAGCCAGCAAGATGCAGCAGAGATGATGACGTCGCTG CTGGCCAGCTTGGAGGAGGAGGGCGGTCAGTATGTGGAAGTGGCACAGCTGCTACAGTCG TTTGAAGATGCCGCGGCGCTGCGGCAGGGCGTGACTCCCTTGGCCTCCTCTCCCCGGGCG TCGGATCCAGTGACGCGAGCTCTCAAGGGTGCCACCTCGCCTCTCTTGGAAGCCGAGACC GCGCCCTCCGCATCGCCGCATCGGCGCAATTACAGCGAGCCCTGCAACATCGAGGAGTAC TCCCAATCATCGCTGCTCTCCTCCACTAGTGAGGACACCTTCCTGCCGGGTCCGCGCAGC GCGCACTTCTTCAACGTACTGCGGCTGATGGAACGGGTCAATCGCGAGAACGAACTACTT GAGCGGCGTGTGAAGCAGCGGCAAGGCATTGCCTACACTAACTCCTTCAAGCCCCCACGG CTACACTTCAACCCGCTGCTGGACGGCTTCCGCGGGTATACGTTGTCGGAGGTGGAGTGC CACAACTGCCGCGCGGTATCGCGCGTAGTGAGCCCCTTTAATGGGTTGTTGCTGGATGTG CCGACGGCGAAGCAGCGCCGGCGCTACGCGTTGGCGCACCCGAATGTGCCGCGCCGCGTC GACTTCGATGGGCAGCTGCGGCAGGTGAAGAAGCCGTTTCGGCTGACCTGGTGGAACCCC CTCTCCCTCTGCGTGGCAGCGTGGAGGCAGCTGAAGCAGTTCTTCCAGGACCCGTTCCCG TACCCGCTCTGGCTGGACGAGTGCCTCGACATTCACTTCGAGCCGGAGGTGCTGCGCGGG TGTAGCAGGTACCGTTGCGAGTCCTGCGACACCACCACCGACGCCACGAAGTCGGAGACG CTTCTTGCTCTGCCCGAGTACCTGCTCATCTACATGAAGCGCTTCGAGGCCGGCCGCTTC TTCAACAGCAAGAAGTCGGACTCAGTCTTCTTTCCCACCTCGTGGCGGCCGCTCACGACG ACGCAGGCGAGGCAGTCGCCTATCAACACGGACGACGCGCCGCCAGCGCTGCCGGAATAT CTCGACCTGCGGCACTACCTGCACAGCAGCGTCGCACCGTTCGCAGAGCCGATCCCGCCC TGTCTGTGGGGTACTGACAACGAGCCCCACCAGCAGCATCATGTGAGCAGGGACGATGCC AGCACCCCCACCAGCTCCATCGCAACCACCTACACGCTAGACGGCATTGTCAACCACCAC GGCGGCTACGACGGCGGCCATTACACAGTCTTCCTCTACAAGGCGACGGAGGAGCGGCAG GCGTGGGTGTACATCAGTGACGATGAGGTGGAGCAAGCGGAGGAAGTAGTGGCGACGGAT ACCGAGTACGTCCTGCTGTATCGCCGCCAACCCCTCGTGCAGGCTGCACCAGAGTCGGAC GAGGCAGAGCAGCTGCGCCGAAAGGCGTGCTACTACCTCTCTCAGTCATCCCCCTCCTGC CCTGCCCCCAACGCCGCGGCGGCGACGACCGACGGCCCTAAAGCCAGCAAGCCTCATAGC AGTTGCCCCTTCTCGTCCTCTTCGGCAGGCGGCGTGGCTAGTACGCCACCTCACGCGGCA ACCGCGGCGACCGAGCCGTGGGTATACATCTCGCGCATGTGGCTTCAGCGCGTCGCCTTC ATGCACGAGCCGGGCCCGATTGTGAATCGGCTGTGTTACTGCCGTCCAGAGGATCGGGGG CGGGTGAGCATGTATCAGAGCATCTTTCCAGCCACAGTGAAAGTGCCAGCGGAGGTGCCC CACGTCCACGGCCCGCCGGTGAGCTGGTTCTACGCGCCCATCACACAGAGGGACTACGAC ATTTTTTACAACGCGTTTGGTGGCAACTTAGCCGTGACGGCCAGCGAGTACGAGTCACTG CGCGCAATGCAGGACAAGTTCTGCGCTGCCATTGATTTAGCGGAACGGCAGCGAGGGAGC GCAGCTCGCCCTGCTCCCCGGCACTGA
  • Download Fasta

  • Fasta :-

    MHLRVLPRCRRTTTSYLLLIMSATAASSRRKQHYESLKEESMIPFEMELDEAIELPFDVN AVAPTDVALSAPFGGKKIPMRAARAASESRVAWSNGSTASVGFAVCGNGKELPSTAATAD GVASPIATPANAAPTTYSAAAPSRMLTWKDTSASQRRAEAQASRQDDFHPMVLCPLQNLG NTCYFNAGVQLLVNCPALVYAVRNSPFARWTRSNGPLTAQAVPMPRAEAAPAATKLCLKG GAAIHTLFQEFSILLARMEMGCAAGERAISPICALDSLAQAYPQFEGRSQQDAAEMMTSL LASLEEEGGQYVEVAQLLQSFEDAAALRQGVTPLASSPRASDPVTRALKGATSPLLEAET APSASPHRRNYSEPCNIEEYSQSSLLSSTSEDTFLPGPRSAHFFNVLRLMERVNRENELL ERRVKQRQGIAYTNSFKPPRLHFNPLLDGFRGYTLSEVECHNCRAVSRVVSPFNGLLLDV PTAKQRRRYALAHPNVPRRVDFDGQLRQVKKPFRLTWWNPLSLCVAAWRQLKQFFQDPFP YPLWLDECLDIHFEPEVLRGCSRYRCESCDTTTDATKSETLLALPEYLLIYMKRFEAGRF FNSKKSDSVFFPTSWRPLTTTQARQSPINTDDAPPALPEYLDLRHYLHSSVAPFAEPIPP CLWGTDNEPHQQHHVSRDDASTPTSSIATTYTLDGIVNHHGGYDGGHYTVFLYKATEERQ AWVYISDDEVEQAEEVVATDTEYVLLYRRQPLVQAAPESDEAEQLRRKACYYLSQSSPSC PAPNAAAATTDGPKASKPHSSCPFSSSSAGGVASTPPHAATAATEPWVYISRMWLQRVAF MHEPGPIVNRLCYCRPEDRGRVSMYQSIFPATVKVPAEVPHVHGPPVSWFYAPITQRDYD IFYNAFGGNLAVTASEYESLRAMQDKFCAAIDLAERQRGSAARPAPRH

    No Results
No Results
No Results
IDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethod
LmjF.09.0240154 SDTSASQRRA0.996unspLmjF.09.0240154 SDTSASQRRA0.996unspLmjF.09.0240154 SDTSASQRRA0.996unspLmjF.09.0240270 SERAISPICA0.995unspLmjF.09.0240303 SSLLASLEEE0.995unspLmjF.09.0240320 SQLLQSFEDA0.993unspLmjF.09.0240337 SPLASSPRAS0.997unspLmjF.09.0240341 SSPRASDPVT0.992unspLmjF.09.0240388 SSLLSSTSED0.99unspLmjF.09.0240626 SQARQSPINT0.998unspLmjF.09.0240863 SRGRVSMYQS0.992unspLmjF.09.024036 SQHYESLKEE0.997unspLmjF.09.0240147 TSRMLTWKDT0.99unsp

LmjF.09.0240      



Dinesh Gupta lab Translational bioinformatics group, ICGEB, New Delhi, India