LmjF.09.0770 | oligopeptidase b

_IDPredictionOTHERSPmTPCS_Position
LmjF.09.0770OTHER0.9999010.0000350.000064
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    >LmjF.09.0770 MSSDSSVAASAQPPIAAKKPHRVTFGYVEGEDRGPNPMNPPRYREDPYFWMRDDDRKDPA VIEHLNKEKVYFQARSADIAQLRDDIYAEHISHINEDDMSAPYVYGKYRYYTREVKGKPY KIYCRVFTDKEPGDVAAEEVIIDVNQVAEGKAFCDVMEVKPAPPEHDLVAFSVDMSGNEV YTIEFKRISDPSQTIADKVSGTNGEIVWGPDHTSLFYVTKDETLRENKVWRHVMGKLQSE DVCLYEEHNPLFSAFMYKAADTNTLCIGSQSPETAEVHLLDLRKGNAHNTLEIVRPREKG VRYDVQMHGTSHLVILTNEGGAVNHKLLIAPRGQPSDWSHVLVDHSEDVFMESIAVRSNY LVVAGRRAGLTRIWTMMADSQDGVFKAGTGLREVVMEEPIFTVHLVESQMLEYEEPTFRM EYSSLATPNTWFDVSPQDHSRTAVKVREVGGGFDAANYKVERRFATAPDQTKIPLSVVYH KDLDMSQPQPCMLYGYGSYGLSMDPQFSIQHLPYCDRGMIFAIAHIRGGSELGRAWYEIG AKYLTKRNTFSDFIAAAEFLVNAKLTTPSQLACEGRSAGGLLMGAVLNMRPDLFKVALAG VPFVDVMTTMCDPSIPLTTGEWEEWGNPNEYKYYDYMLSYSPMDNVRAQEYPNIMVQCGL HDPRVAYWEPAKWVSKLRECKTDNNEILLNIDMESGHFSAKDRYKFWKESAIQQAFVCKH LKSTVRLLVRR
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  • MitoProt II - v1.101 File : /home/rajan/sadaf/4480_mitoprot/test/387 Sequence name : 387 Sequence length : 731 VALUES OF COMPUTED PARAMETERS Coef20 : 3.849 CoefTot : -0.624 ChDiff : -21 ZoneTo : 28 KR : 3 DE : 1 CleavSite : 0 HYDROPHOBIC SCALE USED GES KD GVH1 ECS H17 : 0.929 1.453 0.087 0.528 MesoH : -0.023 0.619 -0.207 0.290 MuHd_075 : 25.931 14.951 7.703 5.111 MuHd_095 : 21.175 11.896 4.479 3.931 MuHd_100 : 21.476 6.280 4.906 3.607 MuHd_105 : 25.835 6.388 6.097 4.433 Hmax_075 : 11.783 12.483 2.319 4.040 Hmax_095 : 5.513 9.538 -1.117 2.494 Hmax_100 : 8.200 6.700 -0.007 2.790 Hmax_105 : 8.200 3.600 0.605 3.020 CLASS NOT-MITO MITO(/CHLORO) DFM : 0.9234 0.0766 DFMC : 0.8797 0.1203
  • ##### ProP v.1.0b ProPeptide Cleavage Site Prediction ##### ##### Furin-type cleavage site prediction (Arginine/Lysine residues) ##### 731 LmjF.09.0770 MSSDSSVAASAQPPIAAKKPHRVTFGYVEGEDRGPNPMNPPRYREDPYFWMRDDDRKDPAVIEHLNKEKVYFQARSADIA 80 QLRDDIYAEHISHINEDDMSAPYVYGKYRYYTREVKGKPYKIYCRVFTDKEPGDVAAEEVIIDVNQVAEGKAFCDVMEVK 160 PAPPEHDLVAFSVDMSGNEVYTIEFKRISDPSQTIADKVSGTNGEIVWGPDHTSLFYVTKDETLRENKVWRHVMGKLQSE 240 DVCLYEEHNPLFSAFMYKAADTNTLCIGSQSPETAEVHLLDLRKGNAHNTLEIVRPREKGVRYDVQMHGTSHLVILTNEG 320 GAVNHKLLIAPRGQPSDWSHVLVDHSEDVFMESIAVRSNYLVVAGRRAGLTRIWTMMADSQDGVFKAGTGLREVVMEEPI 400 FTVHLVESQMLEYEEPTFRMEYSSLATPNTWFDVSPQDHSRTAVKVREVGGGFDAANYKVERRFATAPDQTKIPLSVVYH 480 KDLDMSQPQPCMLYGYGSYGLSMDPQFSIQHLPYCDRGMIFAIAHIRGGSELGRAWYEIGAKYLTKRNTFSDFIAAAEFL 560 VNAKLTTPSQLACEGRSAGGLLMGAVLNMRPDLFKVALAGVPFVDVMTTMCDPSIPLTTGEWEEWGNPNEYKYYDYMLSY 640 SPMDNVRAQEYPNIMVQCGLHDPRVAYWEPAKWVSKLRECKTDNNEILLNIDMESGHFSAKDRYKFWKESAIQQAFVCKH 720 LKSTVRLLVRR 800 ................................................................................ 80 ................................................................................ 160 ................................................................................ 240 ................................................................................ 320 ................................................................................ 400 ................................................................................ 480 ................................................................................ 560 ................................................................................ 640 ................................................................................ 720 ........... 800 Propeptide cleavage sites predicted: Arg(R)/Lys(K): 0 Name Pos Context Score Pred ____________________________v_________________ LmjF.09.0770 18 QPPIAAK|KP 0.067 . LmjF.09.0770 19 PPIAAKK|PH 0.093 . LmjF.09.0770 22 AAKKPHR|VT 0.111 . LmjF.09.0770 33 YVEGEDR|GP 0.074 . LmjF.09.0770 42 NPMNPPR|YR 0.126 . LmjF.09.0770 44 MNPPRYR|ED 0.074 . LmjF.09.0770 52 DPYFWMR|DD 0.125 . LmjF.09.0770 56 WMRDDDR|KD 0.091 . LmjF.09.0770 57 MRDDDRK|DP 0.109 . LmjF.09.0770 67 VIEHLNK|EK 0.055 . LmjF.09.0770 69 EHLNKEK|VY 0.066 . LmjF.09.0770 75 KVYFQAR|SA 0.240 . LmjF.09.0770 83 ADIAQLR|DD 0.131 . LmjF.09.0770 107 APYVYGK|YR 0.066 . LmjF.09.0770 109 YVYGKYR|YY 0.116 . LmjF.09.0770 113 KYRYYTR|EV 0.111 . LmjF.09.0770 116 YYTREVK|GK 0.088 . LmjF.09.0770 118 TREVKGK|PY 0.086 . LmjF.09.0770 121 VKGKPYK|IY 0.073 . LmjF.09.0770 125 PYKIYCR|VF 0.092 . LmjF.09.0770 130 CRVFTDK|EP 0.078 . LmjF.09.0770 151 NQVAEGK|AF 0.069 . LmjF.09.0770 160 CDVMEVK|PA 0.068 . LmjF.09.0770 186 VYTIEFK|RI 0.059 . LmjF.09.0770 187 YTIEFKR|IS 0.265 . LmjF.09.0770 198 SQTIADK|VS 0.068 . LmjF.09.0770 220 SLFYVTK|DE 0.072 . LmjF.09.0770 225 TKDETLR|EN 0.081 . LmjF.09.0770 228 ETLRENK|VW 0.102 . LmjF.09.0770 231 RENKVWR|HV 0.298 . LmjF.09.0770 236 WRHVMGK|LQ 0.072 . LmjF.09.0770 258 FSAFMYK|AA 0.093 . LmjF.09.0770 283 VHLLDLR|KG 0.065 . LmjF.09.0770 284 HLLDLRK|GN 0.076 . LmjF.09.0770 295 NTLEIVR|PR 0.079 . LmjF.09.0770 297 LEIVRPR|EK 0.099 . LmjF.09.0770 299 IVRPREK|GV 0.077 . LmjF.09.0770 302 PREKGVR|YD 0.102 . LmjF.09.0770 326 GGAVNHK|LL 0.067 . LmjF.09.0770 332 KLLIAPR|GQ 0.076 . LmjF.09.0770 357 MESIAVR|SN 0.151 . LmjF.09.0770 366 YLVVAGR|RA 0.093 . LmjF.09.0770 367 LVVAGRR|AG 0.099 . LmjF.09.0770 372 RRAGLTR|IW 0.123 . LmjF.09.0770 386 SQDGVFK|AG 0.067 . LmjF.09.0770 392 KAGTGLR|EV 0.133 . LmjF.09.0770 419 YEEPTFR|ME 0.083 . LmjF.09.0770 441 SPQDHSR|TA 0.142 . LmjF.09.0770 445 HSRTAVK|VR 0.069 . LmjF.09.0770 447 RTAVKVR|EV 0.350 . LmjF.09.0770 459 FDAANYK|VE 0.057 . LmjF.09.0770 462 ANYKVER|RF 0.098 . LmjF.09.0770 463 NYKVERR|FA 0.212 . LmjF.09.0770 472 TAPDQTK|IP 0.059 . LmjF.09.0770 481 LSVVYHK|DL 0.102 . LmjF.09.0770 517 HLPYCDR|GM 0.088 . LmjF.09.0770 527 FAIAHIR|GG 0.100 . LmjF.09.0770 534 GGSELGR|AW 0.127 . LmjF.09.0770 542 WYEIGAK|YL 0.063 . LmjF.09.0770 546 GAKYLTK|RN 0.061 . LmjF.09.0770 547 AKYLTKR|NT 0.164 . LmjF.09.0770 564 EFLVNAK|LT 0.063 . LmjF.09.0770 576 QLACEGR|SA 0.318 . LmjF.09.0770 590 GAVLNMR|PD 0.067 . LmjF.09.0770 595 MRPDLFK|VA 0.074 . LmjF.09.0770 632 GNPNEYK|YY 0.087 . LmjF.09.0770 647 SPMDNVR|AQ 0.099 . LmjF.09.0770 664 CGLHDPR|VA 0.084 . LmjF.09.0770 672 AYWEPAK|WV 0.086 . LmjF.09.0770 676 PAKWVSK|LR 0.060 . LmjF.09.0770 678 KWVSKLR|EC 0.085 . LmjF.09.0770 681 SKLRECK|TD 0.100 . LmjF.09.0770 701 SGHFSAK|DR 0.081 . LmjF.09.0770 703 HFSAKDR|YK 0.182 . LmjF.09.0770 705 SAKDRYK|FW 0.082 . LmjF.09.0770 708 DRYKFWK|ES 0.088 . LmjF.09.0770 719 QQAFVCK|HL 0.071 . LmjF.09.0770 722 FVCKHLK|ST 0.073 . LmjF.09.0770 726 HLKSTVR|LL 0.077 . LmjF.09.0770 730 TVRLLVR|R- 0.084 . LmjF.09.0770 731 VRLLVRR|-- 0.143 . ____________________________^_________________

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    >LmjF.09.0770 ATGTCGTCGGACAGCTCCGTCGCGGCCTCTGCGCAGCCGCCGATCGCCGCCAAGAAGCCG CACCGCGTCACGTTCGGCTACGTGGAGGGTGAGGACCGCGGCCCGAACCCGATGAACCCG CCGCGCTACCGCGAGGACCCGTATTTTTGGATGCGCGATGACGATCGTAAGGATCCGGCC GTGATTGAGCACCTCAACAAGGAGAAGGTCTACTTCCAGGCGCGCAGCGCCGACATTGCG CAGCTGCGCGACGACATTTACGCAGAGCACATATCGCACATCAATGAGGACGACATGTCC GCGCCGTACGTGTATGGCAAGTACCGGTACTACACCCGCGAGGTGAAGGGTAAGCCGTAC AAGATTTACTGCCGCGTGTTCACGGACAAGGAGCCGGGCGACGTCGCGGCGGAAGAGGTC ATCATCGATGTCAACCAGGTCGCCGAGGGCAAAGCGTTCTGTGACGTGATGGAGGTGAAG CCGGCACCGCCGGAGCATGACCTTGTAGCCTTTTCTGTGGACATGAGCGGTAACGAGGTG TACACGATCGAATTTAAAAGGATTTCGGACCCGTCCCAAACCATCGCCGACAAGGTGAGT GGCACCAATGGCGAGATCGTGTGGGGCCCGGACCACACCTCCTTATTCTACGTGACCAAA GACGAGACGCTGCGCGAAAACAAGGTGTGGCGCCACGTGATGGGCAAGCTGCAGTCCGAG GACGTCTGCCTCTACGAGGAGCACAACCCGCTGTTCAGTGCCTTCATGTACAAGGCCGCG GACACAAACACACTTTGCATCGGCTCGCAGTCACCGGAGACGGCGGAGGTGCACCTGCTT GATCTGCGCAAGGGCAACGCCCACAATACGCTGGAGATTGTGCGGCCGCGCGAGAAGGGT GTGCGCTACGACGTGCAGATGCACGGCACCAGCCATCTTGTGATCCTCACCAACGAAGGT GGGGCGGTGAACCACAAGCTTCTCATAGCGCCGCGTGGGCAGCCGAGCGACTGGTCGCAT GTGCTGGTGGATCACAGCGAGGATGTGTTTATGGAGAGCATCGCGGTGCGCTCGAACTAC CTCGTCGTGGCAGGCCGCCGCGCCGGGCTGACGCGCATCTGGACGATGATGGCGGACTCG CAGGATGGTGTCTTCAAGGCTGGCACCGGGCTGCGCGAGGTGGTGATGGAGGAGCCGATC TTCACGGTGCACCTCGTGGAGTCCCAGATGTTGGAGTACGAAGAGCCGACGTTCCGCATG GAGTACTCCTCCCTTGCCACGCCGAACACCTGGTTCGACGTCAGCCCGCAGGACCACTCT CGCACCGCTGTGAAAGTGCGCGAGGTCGGCGGTGGCTTCGACGCCGCCAACTACAAGGTG GAGCGCCGCTTCGCTACCGCACCGGACCAGACCAAGATCCCGCTCTCAGTTGTGTACCAC AAAGACCTCGACATGAGCCAGCCGCAGCCGTGCATGCTCTACGGGTACGGCAGCTACGGC CTTAGCATGGACCCGCAGTTCAGTATTCAGCACCTGCCATACTGTGACCGCGGCATGATC TTCGCCATAGCCCACATCCGCGGCGGCAGTGAGCTGGGCCGTGCATGGTACGAGATCGGC GCCAAGTACCTCACGAAGCGCAACACCTTTTCCGACTTCATCGCGGCAGCCGAATTCCTG GTGAACGCGAAATTGACGACGCCGTCGCAGCTGGCCTGCGAGGGGCGTAGCGCCGGTGGC CTGCTGATGGGCGCCGTGCTGAACATGCGACCCGATCTCTTCAAGGTGGCGCTCGCCGGC GTACCGTTCGTGGATGTCATGACGACCATGTGCGACCCCAGCATTCCCTTGACGACGGGC GAGTGGGAGGAGTGGGGCAACCCGAACGAGTACAAGTACTACGACTACATGCTGAGCTAC AGCCCCATGGACAACGTCCGCGCGCAGGAGTACCCGAACATCATGGTCCAGTGCGGCCTG CACGACCCCCGCGTCGCCTATTGGGAGCCGGCCAAGTGGGTGAGCAAGCTGCGTGAGTGC AAGACGGACAACAACGAAATTCTGCTGAACATAGACATGGAGAGCGGGCACTTCTCCGCC AAGGATCGCTACAAGTTCTGGAAGGAGTCGGCTATCCAGCAAGCGTTCGTGTGCAAGCAC CTGAAGAGCACCGTGCGCCTGCTGGTTCGCAGGTAA
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    MSSDSSVAASAQPPIAAKKPHRVTFGYVEGEDRGPNPMNPPRYREDPYFWMRDDDRKDPA VIEHLNKEKVYFQARSADIAQLRDDIYAEHISHINEDDMSAPYVYGKYRYYTREVKGKPY KIYCRVFTDKEPGDVAAEEVIIDVNQVAEGKAFCDVMEVKPAPPEHDLVAFSVDMSGNEV YTIEFKRISDPSQTIADKVSGTNGEIVWGPDHTSLFYVTKDETLRENKVWRHVMGKLQSE DVCLYEEHNPLFSAFMYKAADTNTLCIGSQSPETAEVHLLDLRKGNAHNTLEIVRPREKG VRYDVQMHGTSHLVILTNEGGAVNHKLLIAPRGQPSDWSHVLVDHSEDVFMESIAVRSNY LVVAGRRAGLTRIWTMMADSQDGVFKAGTGLREVVMEEPIFTVHLVESQMLEYEEPTFRM EYSSLATPNTWFDVSPQDHSRTAVKVREVGGGFDAANYKVERRFATAPDQTKIPLSVVYH KDLDMSQPQPCMLYGYGSYGLSMDPQFSIQHLPYCDRGMIFAIAHIRGGSELGRAWYEIG AKYLTKRNTFSDFIAAAEFLVNAKLTTPSQLACEGRSAGGLLMGAVLNMRPDLFKVALAG VPFVDVMTTMCDPSIPLTTGEWEEWGNPNEYKYYDYMLSYSPMDNVRAQEYPNIMVQCGL HDPRVAYWEPAKWVSKLRECKTDNNEILLNIDMESGHFSAKDRYKFWKESAIQQAFVCKH LKSTVRLLVRR

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IDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethodIDSitePeptideScoreMethod
LmjF.09.0770699 SSGHFSAKDR0.992unspLmjF.09.0770699 SSGHFSAKDR0.992unspLmjF.09.0770699 SSGHFSAKDR0.992unspLmjF.09.0770435 SWFDVSPQDH0.994unspLmjF.09.0770641 SMLSYSPMDN0.992unsp

LmjF.09.0770      



Dinesh Gupta lab Translational bioinformatics group, ICGEB, New Delhi, India