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No Results
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Fasta :-
>PCHAS_0412850
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SIQRNKNPFKTHKILSFHLKNQINKKINSIKRVRQFSHPSFYIQNKRKKTKNRKTYMETK
TNTTNFVDETEQAKTTGKLPSNHLSKLRNMFQFA
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MitoProt II - v1.101
File : /home/rajan/sadaf/4480_mitoprot/test/PCHAS_0412850.fa
Sequence name : PCHAS_0412850
Sequence length : 1294
VALUES OF COMPUTED PARAMETERS
Coef20 : 4.117
CoefTot : -1.640
ChDiff : 63
ZoneTo : 42
KR : 10
DE : 1
CleavSite : 0
HYDROPHOBIC SCALE USED
GES KD GVH1 ECS
H17 : 1.200 1.700 0.023 0.595
MesoH : -0.132 0.586 -0.388 0.296
MuHd_075 : 34.511 25.618 13.303 8.669
MuHd_095 : 38.817 26.812 13.011 9.096
MuHd_100 : 28.175 18.963 9.548 6.610
MuHd_105 : 23.515 15.596 7.077 5.911
Hmax_075 : 14.400 17.617 5.806 6.790
Hmax_095 : 15.400 19.000 4.777 4.874
Hmax_100 : 12.100 16.400 3.355 4.990
Hmax_105 : -3.850 5.162 -2.109 1.913
CLASS NOT-MITO MITO(/CHLORO)
DFM : 0.0747 0.9253
DFMC : 0.1207 0.8793
This protein is probably imported in mitochondria.
f(Ser) = 0.0238 f(Arg) = 0.0476 CMi = 0.17422
CMi is the Chloroplast/Mitochondria Index
It has been proposed by Von Heijne et al
(Eur J Biochem,1989, 180: 535-545)
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Fasta :-
>PCHAS_0412850
ATGAAGGGTACATGTGCAGCTAGATATTTTAAGAGTGTAATTGAAAAAAAAATATGCAAT
ACAATATATTTTCAAGCAAAAAGAAAATTTATTAATGTACCTAAATTAAAAACATTACAA
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AATACAAATTTAGAAATATATAAAAATATTAACATATCCAATTTTATGTTTCCATTGGCT
ATTAATTTACTAACTATAAATAATGATGAAAATGCAATTAAATTAAAAAAAAACGATAAT
CATAAATATATTAACGATATTACAGAATTAAATAAAAATAATTTTCTTATTATTGACATT
TTATATAATTATAATTTTTATTATTCAATAAATAGTAATAAAGAAAATCAGTTCAAAAAA
AATAATGTCTACATATCTTACTATAGTAGCCATATAAATAAAAATAACAAAAGAATGCTC
AATTATGAAAAATATATTATATATAGGTTAATCAAAAAAAGAGGATACAACTATATTTCT
ATTGATGCAAAAACTTATGTGAAAAATAAAAAAATAAATTCCGATAATAGTTTAAATAAA
AATTATATAAACAATTTAATATTCGATTTAATGAAAAGACAAAAAAAAAGAAATCTTCAT
TCTATACAGAGAAATAAAAACCCTTTTAAAACGCATAAAATATTATCCTTTCATTTAAAA
AATCAAATAAACAAAAAAATTAATTCGATAAAAAGAGTTCGTCAATTTTCACATCCATCA
TTTTATATCCAAAATAAAAGGAAAAAGACAAAAAACAGAAAAACATATATGGAAACAAAA
ACTAATACAACAAATTTTGTTGACGAAACAGAACAAGCTAAGACAACAGGGAAGCTCCCA
TCAAATCATTTGTCTAAGCTAAGGAACATGTTCCAGTTCGCGTAA
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ID | Site | Peptide | Score | Method | ID | Site | Peptide | Score | Method | ID | Site | Peptide | Score | Method | ID | Site | Peptide | Score | Method | ID | Site | Peptide | Score | Method | ID | Site | Peptide | Score | Method |
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PCHAS_0412850 | 728 S | DKSHSIINS | 0.995 | unsp | PCHAS_0412850 | 728 S | DKSHSIINS | 0.995 | unsp | PCHAS_0412850 | 728 S | DKSHSIINS | 0.995 | unsp | PCHAS_0412850 | 790 S | NEKLSNHDI | 0.993 | unsp | PCHAS_0412850 | 158 S | NKNMSYKDL | 0.998 | unsp | PCHAS_0412850 | 478 Y | SNETYDDNY | 0.992 | unsp |