Loading, please wait...
_ID
Prediction
OTHER
SP
mTP
CS_Position
EHI_043740 OTHER 0.796143 0.203680 0.000178
Showing 1 to 1 of 1 rows
No Results
  • Fasta :-

    >EHI_043740 MTSNDVFIKMLPLLIFIPDYICNVNYSLNYPTLKIKDIPLNPFSPVSLLPVNLSLPLTPN SFFLPFYKNFEVNCHPLYSSPVSYKFSEDFIQKLNEINHPYALQLLLHIKSTEPKTLLHP LLKCLIQYENQTLQNNTLSIEPNCLQSDELLENLTEQIYILPFNNLNISLPSNNINNLTF NESYQIYVLLLKQQPEHCLSIIRQLVNIIGNPFSSGIVQSLPDEFKPTISQVIIESIPSH PLMSNYFEESLQYLQTISKKTNLLPSLIYVLNSLNTLTKEELMKREELIVDFIEYCLNHI TNLSEQLKLAFTEGCSNFIRVLYDFDDLTLPIAKETSLRYRIIDILTQIIQIYPNVITSL SITFKNCIEPLNYTPYNPLSYGIFSNSGSSTPSRSVSRSDLYSTISRSGSLNFNESYCES KSRNSKSKSESSKSLKRSGRKNNNIETVKIGNIIGIRNLGSTCYLNSILQQLYGDVYFRN SMLLIDSIKPEQPFLSSLRDLFIKLMRSSIVIDPRTEVSEMRNKKYGIIKPGVQRDACEM LMEILDSVSDELKGNLGINALKKSYLIEALTEIRSCDCSHNQQRVEEHVVLPLEIKGLKN LEESLEILTGTEYIGDKQYKCEECHKQINIKKQMFLHQLPNTLIFQLKRFDFNLQTFQQE KINSRFLFPDYINLRPFTFTKIKDEEYCLAGVIVHSGNCTGGHYTSYIKDGSKWFLCNDE QVIEVKREYAEMEWFGTKNKSGYLLFYRRITPLEEIPSISIKTTTVPIEKEQKSSKKNKK GKSKKGYETKFEIIKDGEKKNGNSCLSSTLTSSISESTQSSSIDLNEEINEFEQQESIYT EQYLFDENIFYSFLLELYQHIEICTKETVSFIIQIIMFSLNERRNEDFCEERKQLLNYVL ENPCQIVAESLIENEINNKVIMTKRYCFNPRSTSSKYTSYVIDCLKLCSIEINQRYLYQL FVFYSTLTLTKAHVHGIKTLFGNGLRLLTDLSSLKCSIDNAVMKQLFLSIKQSDFILXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLKQNIILTYKNH
  • Download Fasta
  • MitoProt II - v1.101 File : /home/rajan/sadaf/4480_mitoprot/test/EHI_043740.fa Sequence name : EHI_043740 Sequence length : 1063 VALUES OF COMPUTED PARAMETERS Coef20 : 3.841 CoefTot : -4.229 ChDiff : -5 ZoneTo : 87 KR : 5 DE : 4 CleavSite : 0 HYDROPHOBIC SCALE USED GES KD GVH1 ECS H17 : 1.194 1.865 0.158 0.672 MesoH : 0.054 0.556 -0.254 0.341 MuHd_075 : 37.201 22.822 10.408 7.523 MuHd_095 : 27.320 22.088 8.282 6.054 MuHd_100 : 32.880 22.062 8.944 5.853 MuHd_105 : 33.271 25.977 9.442 7.677 Hmax_075 : 19.250 21.583 4.097 7.840 Hmax_095 : 11.900 13.400 2.265 5.330 Hmax_100 : 21.500 23.300 4.970 7.940 Hmax_105 : 22.050 22.300 5.706 7.720 CLASS NOT-MITO MITO(/CHLORO) DFM : 0.9928 0.0072 DFMC : 0.9948 0.0052
  • ##### ProP v.1.0b ProPeptide Cleavage Site Prediction ##### ##### Furin-type cleavage site prediction (Arginine/Lysine residues) ##### 1063 EHI_043740 MTSNDVFIKMLPLLIFIPDYICNVNYSLNYPTLKIKDIPLNPFSPVSLLPVNLSLPLTPNSFFLPFYKNFEVNCHPLYSS 80 PVSYKFSEDFIQKLNEINHPYALQLLLHIKSTEPKTLLHPLLKCLIQYENQTLQNNTLSIEPNCLQSDELLENLTEQIYI 160 LPFNNLNISLPSNNINNLTFNESYQIYVLLLKQQPEHCLSIIRQLVNIIGNPFSSGIVQSLPDEFKPTISQVIIESIPSH 240 PLMSNYFEESLQYLQTISKKTNLLPSLIYVLNSLNTLTKEELMKREELIVDFIEYCLNHITNLSEQLKLAFTEGCSNFIR 320 VLYDFDDLTLPIAKETSLRYRIIDILTQIIQIYPNVITSLSITFKNCIEPLNYTPYNPLSYGIFSNSGSSTPSRSVSRSD 400 LYSTISRSGSLNFNESYCESKSRNSKSKSESSKSLKRSGRKNNNIETVKIGNIIGIRNLGSTCYLNSILQQLYGDVYFRN 480 SMLLIDSIKPEQPFLSSLRDLFIKLMRSSIVIDPRTEVSEMRNKKYGIIKPGVQRDACEMLMEILDSVSDELKGNLGINA 560 LKKSYLIEALTEIRSCDCSHNQQRVEEHVVLPLEIKGLKNLEESLEILTGTEYIGDKQYKCEECHKQINIKKQMFLHQLP 640 NTLIFQLKRFDFNLQTFQQEKINSRFLFPDYINLRPFTFTKIKDEEYCLAGVIVHSGNCTGGHYTSYIKDGSKWFLCNDE 720 QVIEVKREYAEMEWFGTKNKSGYLLFYRRITPLEEIPSISIKTTTVPIEKEQKSSKKNKKGKSKKGYETKFEIIKDGEKK 800 NGNSCLSSTLTSSISESTQSSSIDLNEEINEFEQQESIYTEQYLFDENIFYSFLLELYQHIEICTKETVSFIIQIIMFSL 880 NERRNEDFCEERKQLLNYVLENPCQIVAESLIENEINNKVIMTKRYCFNPRSTSSKYTSYVIDCLKLCSIEINQRYLYQL 960 FVFYSTLTLTKAHVHGIKTLFGNGLRLLTDLSSLKCSIDNAVMKQLFLSIKQSDFILXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX 1040 XXXXXXXXXXXLKQNIILTYKNH 1120 ................................................................................ 80 ................................................................................ 160 ................................................................................ 240 ................................................................................ 320 ................................................................................ 400 ................................................................................ 480 ................................................................................ 560 ................................................................................ 640 ................................................................................ 720 ................................................................................ 800 ................................................................................ 880 ................................................................................ 960 ................................................................................ 1040 ....................... 1120 Propeptide cleavage sites predicted: Arg(R)/Lys(K): 0 Name Pos Context Score Pred ____________________________v_________________ EHI_043740 9 SNDVFIK|ML 0.063 . EHI_043740 34 LNYPTLK|IK 0.064 . EHI_043740 36 YPTLKIK|DI 0.069 . EHI_043740 68 FFLPFYK|NF 0.059 . EHI_043740 85 SSPVSYK|FS 0.084 . EHI_043740 93 SEDFIQK|LN 0.061 . EHI_043740 110 QLLLHIK|ST 0.088 . EHI_043740 115 IKSTEPK|TL 0.068 . EHI_043740 123 LLHPLLK|CL 0.082 . EHI_043740 192 IYVLLLK|QQ 0.052 . EHI_043740 203 HCLSIIR|QL 0.078 . EHI_043740 226 SLPDEFK|PT 0.066 . EHI_043740 259 YLQTISK|KT 0.056 . EHI_043740 260 LQTISKK|TN 0.067 . EHI_043740 279 SLNTLTK|EE 0.062 . EHI_043740 284 TKEELMK|RE 0.068 . EHI_043740 285 KEELMKR|EE 0.114 . EHI_043740 308 NLSEQLK|LA 0.083 . EHI_043740 320 GCSNFIR|VL 0.103 . EHI_043740 334 LTLPIAK|ET 0.059 . EHI_043740 339 AKETSLR|YR 0.088 . EHI_043740 341 ETSLRYR|II 0.121 . EHI_043740 365 SLSITFK|NC 0.073 . EHI_043740 394 GSSTPSR|SV 0.359 . EHI_043740 398 PSRSVSR|SD 0.116 . EHI_043740 407 LYSTISR|SG 0.122 . EHI_043740 421 ESYCESK|SR 0.073 . EHI_043740 423 YCESKSR|NS 0.083 . EHI_043740 426 SKSRNSK|SK 0.348 . EHI_043740 428 SRNSKSK|SE 0.108 . EHI_043740 433 SKSESSK|SL 0.124 . EHI_043740 436 ESSKSLK|RS 0.081 . EHI_043740 437 SSKSLKR|SG 0.278 . EHI_043740 440 SLKRSGR|KN 0.346 . EHI_043740 441 LKRSGRK|NN 0.078 . EHI_043740 449 NNIETVK|IG 0.059 . EHI_043740 457 GNIIGIR|NL 0.076 . EHI_043740 479 YGDVYFR|NS 0.075 . EHI_043740 489 LLIDSIK|PE 0.065 . EHI_043740 499 PFLSSLR|DL 0.105 . EHI_043740 504 LRDLFIK|LM 0.063 . EHI_043740 507 LFIKLMR|SS 0.119 . EHI_043740 515 SIVIDPR|TE 0.076 . EHI_043740 522 TEVSEMR|NK 0.088 . EHI_043740 524 VSEMRNK|KY 0.073 . EHI_043740 525 SEMRNKK|YG 0.347 . EHI_043740 530 KKYGIIK|PG 0.062 . EHI_043740 535 IKPGVQR|DA 0.150 . EHI_043740 553 SVSDELK|GN 0.066 . EHI_043740 562 LGINALK|KS 0.060 . EHI_043740 563 GINALKK|SY 0.169 . EHI_043740 574 EALTEIR|SC 0.105 . EHI_043740 584 CSHNQQR|VE 0.103 . EHI_043740 596 VLPLEIK|GL 0.064 . EHI_043740 599 LEIKGLK|NL 0.065 . EHI_043740 617 TEYIGDK|QY 0.066 . EHI_043740 620 IGDKQYK|CE 0.066 . EHI_043740 626 KCEECHK|QI 0.071 . EHI_043740 631 HKQINIK|KQ 0.060 . EHI_043740 632 KQINIKK|QM 0.090 . EHI_043740 648 TLIFQLK|RF 0.076 . EHI_043740 649 LIFQLKR|FD 0.163 . EHI_043740 661 QTFQQEK|IN 0.064 . EHI_043740 665 QEKINSR|FL 0.090 . EHI_043740 675 PDYINLR|PF 0.068 . EHI_043740 681 RPFTFTK|IK 0.069 . EHI_043740 683 FTFTKIK|DE 0.076 . EHI_043740 709 HYTSYIK|DG 0.060 . EHI_043740 713 YIKDGSK|WF 0.057 . EHI_043740 726 EQVIEVK|RE 0.065 . EHI_043740 727 QVIEVKR|EY 0.153 . EHI_043740 738 MEWFGTK|NK 0.065 . EHI_043740 740 WFGTKNK|SG 0.065 . EHI_043740 748 GYLLFYR|RI 0.085 . EHI_043740 749 YLLFYRR|IT 0.095 . EHI_043740 762 IPSISIK|TT 0.076 . EHI_043740 770 TTVPIEK|EQ 0.056 . EHI_043740 773 PIEKEQK|SS 0.074 . EHI_043740 776 KEQKSSK|KN 0.069 . EHI_043740 777 EQKSSKK|NK 0.090 . EHI_043740 779 KSSKKNK|KG 0.083 . EHI_043740 780 SSKKNKK|GK 0.196 . EHI_043740 782 KKNKKGK|SK 0.170 . EHI_043740 784 NKKGKSK|KG 0.064 . EHI_043740 785 KKGKSKK|GY 0.238 . EHI_043740 790 KKGYETK|FE 0.073 . EHI_043740 795 TKFEIIK|DG 0.076 . EHI_043740 799 IIKDGEK|KN 0.060 . EHI_043740 800 IKDGEKK|NG 0.094 . EHI_043740 866 HIEICTK|ET 0.059 . EHI_043740 883 MFSLNER|RN 0.084 . EHI_043740 884 FSLNERR|NE 0.108 . EHI_043740 892 EDFCEER|KQ 0.062 . EHI_043740 893 DFCEERK|QL 0.065 . EHI_043740 919 ENEINNK|VI 0.061 . EHI_043740 924 NKVIMTK|RY 0.063 . EHI_043740 925 KVIMTKR|YC 0.190 . EHI_043740 931 RYCFNPR|ST 0.183 . EHI_043740 936 PRSTSSK|YT 0.151 . EHI_043740 946 YVIDCLK|LC 0.062 . EHI_043740 955 SIEINQR|YL 0.088 . EHI_043740 971 STLTLTK|AH 0.062 . EHI_043740 978 AHVHGIK|TL 0.063 . EHI_043740 986 LFGNGLR|LL 0.067 . EHI_043740 995 TDLSSLK|CS 0.060 . EHI_043740 1004 IDNAVMK|QL 0.086 . EHI_043740 1011 QLFLSIK|QS 0.075 . EHI_043740 1053 XXXXXLK|QN 0.063 . EHI_043740 1061 NIILTYK|NH 0.058 . ____________________________^_________________
  • Fasta :-

    >EHI_043740 ATGACATCAAATGATGTATTTATTAAAATGCTTCCGTTGTTAATTTTCATTCCTGATTAT ATTTGTAACGTTAATTATTCATTAAATTATCCAACTCTCAAAATAAAGGATATTCCATTA AACCCATTTTCTCCAGTATCGTTGTTACCTGTCAATTTATCACTTCCATTAACACCAAAC TCATTTTTTCTTCCATTTTATAAAAATTTTGAAGTTAATTGTCATCCTTTATATTCTTCA CCAGTTTCATATAAATTTTCAGAAGATTTTATTCAAAAATTAAATGAAATTAATCACCCA TATGCATTACAATTACTTCTCCATATTAAATCAACTGAACCTAAAACCTTACTTCATCCA CTGTTAAAATGTTTAATTCAATATGAAAATCAAACACTTCAAAATAACACTCTTTCTATT GAACCTAATTGTTTACAATCAGATGAATTACTAGAAAATTTAACAGAACAAATTTATATA CTTCCATTTAATAATTTAAATATTTCATTACCATCAAATAATATAAACAATTTAACATTT AATGAATCTTATCAAATATATGTGTTATTATTAAAACAACAACCTGAACATTGTCTATCA ATAATAAGACAATTAGTTAATATTATTGGAAATCCATTCAGTTCTGGAATTGTGCAATCA TTGCCTGATGAATTTAAGCCAACTATTAGTCAAGTAATTATTGAATCAATACCTTCTCAT CCTTTAATGTCAAATTATTTTGAAGAATCATTACAATATTTACAAACGATATCAAAAAAA ACTAATTTATTACCATCATTAATTTATGTACTTAATTCATTAAATACATTAACTAAAGAA GAATTAATGAAAAGAGAAGAGTTAATTGTTGACTTTATAGAGTATTGTTTAAATCACATT ACAAATTTATCTGAACAATTAAAATTAGCATTTACTGAAGGATGTTCCAATTTCATTAGA GTGTTATATGATTTTGATGATTTAACACTTCCAATAGCAAAAGAAACCAGTTTAAGGTAT CGAATTATTGATATACTAACTCAAATTATTCAAATTTATCCAAATGTAATAACATCTCTT AGTATTACATTCAAAAATTGTATTGAACCATTAAATTATACTCCATACAATCCACTTAGT TATGGAATATTTTCTAATAGTGGAAGTTCAACACCAAGTAGATCAGTTAGTAGATCAGAT TTATATTCTACTATTTCAAGGAGTGGAAGTTTAAATTTTAATGAAAGTTATTGTGAAAGT AAAAGCAGAAACTCTAAAAGTAAAAGTGAATCTTCTAAATCATTAAAAAGAAGTGGTAGA AAGAATAACAATATTGAAACAGTAAAAATTGGAAATATCATTGGAATAAGAAACCTTGGT AGTACGTGTTATTTAAACTCTATTCTACAACAATTATATGGAGATGTTTATTTTAGAAAT TCAATGCTTCTCATAGATTCAATTAAACCTGAACAACCATTTTTAAGTTCATTAAGAGAT TTATTTATTAAATTAATGAGGTCAAGTATTGTTATTGATCCAAGAACCGAAGTTAGTGAA ATGAGAAATAAAAAATATGGAATAATTAAGCCAGGTGTTCAAAGAGATGCATGTGAAATG TTAATGGAAATACTTGACTCAGTAAGTGATGAATTAAAAGGAAATCTTGGAATTAATGCA TTAAAAAAATCATATTTAATTGAAGCATTAACAGAAATAAGATCATGTGATTGTTCACAT AATCAACAAAGAGTTGAAGAACATGTAGTGTTACCATTAGAAATTAAAGGATTAAAAAAT TTAGAAGAGTCATTAGAAATATTAACAGGTACTGAATATATTGGAGATAAACAATATAAA TGTGAAGAATGTCATAAACAAATTAATATTAAAAAGCAAATGTTTCTTCATCAATTACCA AATACATTAATATTTCAATTAAAAAGATTTGATTTTAACCTTCAAACATTTCAACAAGAA AAAATTAATTCTCGTTTTCTATTTCCTGATTATATTAATTTAAGACCTTTTACATTTACT AAAATTAAAGATGAAGAGTATTGTCTTGCTGGAGTTATTGTTCATTCAGGAAACTGTACT GGAGGACATTACACATCATATATTAAAGATGGAAGTAAATGGTTTTTATGTAATGATGAA CAAGTTATTGAAGTAAAAAGAGAGTATGCAGAAATGGAATGGTTTGGAACAAAAAATAAA TCAGGATATCTTCTTTTTTATCGTAGAATTACTCCTCTTGAAGAAATTCCATCAATTTCA ATTAAAACAACAACAGTTCCAATTGAAAAAGAACAAAAATCTTCAAAAAAGAATAAAAAA GGAAAATCAAAAAAAGGATATGAAACGAAATTTGAAATTATTAAAGACGGAGAAAAGAAA AATGGAAATAGTTGTTTATCATCAACTTTAACTTCTTCAATTTCAGAATCTACACAAAGT TCTTCAATTGATTTAAATGAAGAAATCAATGAATTTGAACAACAAGAGAGTATTTATACA GAACAATATTTATTTGATGAAAACATATTTTATTCATTTTTACTAGAATTATATCAACAT ATAGAAATTTGTACAAAAGAAACTGTTTCATTTATTATTCAAATTATTATGTTTAGTTTA AATGAACGTAGAAATGAAGATTTTTGTGAAGAAAGAAAACAATTATTAAATTATGTATTA GAAAATCCTTGTCAAATTGTAGCTGAGTCATTAATTGAAAATGAAATTAATAATAAAGTA ATAATGACAAAAAGATATTGTTTCAATCCACGTTCCACTTCATCAAAATATACTTCATAT GTTATTGACTGTTTAAAATTATGTTCAATTGAAATTAATCAACGTTACCTTTATCAATTA TTTGTATTTTATTCAACACTTACATTAACTAAAGCTCATGTCCATGGAATTAAAACATTG TTTGGAAATGGATTAAGATTATTAACTGATTTAAGTTCTTTAAAATGTTCTATTGATAAT GCTGTTATGAAACAGTTATTTTTATCAATTAAACAATCTGATTTTATTTTAGANNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAAACAAAACATCATTTTGACTTAC AAAAATCATTAG
  • Download Fasta
  • Fasta :-

    MTSNDVFIKMLPLLIFIPDYICNVNYSLNYPTLKIKDIPLNPFSPVSLLPVNLSLPLTPN SFFLPFYKNFEVNCHPLYSSPVSYKFSEDFIQKLNEINHPYALQLLLHIKSTEPKTLLHP LLKCLIQYENQTLQNNTLSIEPNCLQSDELLENLTEQIYILPFNNLNISLPSNNINNLTF NESYQIYVLLLKQQPEHCLSIIRQLVNIIGNPFSSGIVQSLPDEFKPTISQVIIESIPSH PLMSNYFEESLQYLQTISKKTNLLPSLIYVLNSLNTLTKEELMKREELIVDFIEYCLNHI TNLSEQLKLAFTEGCSNFIRVLYDFDDLTLPIAKETSLRYRIIDILTQIIQIYPNVITSL SITFKNCIEPLNYTPYNPLSYGIFSNSGSSTPSRSVSRSDLYSTISRSGSLNFNESYCES KSRNSKSKSESSKSLKRSGRKNNNIETVKIGNIIGIRNLGSTCYLNSILQQLYGDVYFRN SMLLIDSIKPEQPFLSSLRDLFIKLMRSSIVIDPRTEVSEMRNKKYGIIKPGVQRDACEM LMEILDSVSDELKGNLGINALKKSYLIEALTEIRSCDCSHNQQRVEEHVVLPLEIKGLKN LEESLEILTGTEYIGDKQYKCEECHKQINIKKQMFLHQLPNTLIFQLKRFDFNLQTFQQE KINSRFLFPDYINLRPFTFTKIKDEEYCLAGVIVHSGNCTGGHYTSYIKDGSKWFLCNDE QVIEVKREYAEMEWFGTKNKSGYLLFYRRITPLEEIPSISIKTTTVPIEKEQKSSKKNKK GKSKKGYETKFEIIKDGEKKNGNSCLSSTLTSSISESTQSSSIDLNEEINEFEQQESIYT EQYLFDENIFYSFLLELYQHIEICTKETVSFIIQIIMFSLNERRNEDFCEERKQLLNYVL ENPCQIVAESLIENEINNKVIMTKRYCFNPRSTSSKYTSYVIDCLKLCSIEINQRYLYQL FVFYSTLTLTKAHVHGIKTLFGNGLRLLTDLSSLKCSIDNAVMKQLFLSIKQSDFILXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLKQNIILTYKNH

  • title: Active Site
  • coordinates: N458,C463,H703,D719
No Results
No Results
Loading, please wait...
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
ID
Site
Peptide
Score
Method
EHI_043740 397 S SRSVSRSDL 0.998 unsp EHI_043740 397 S SRSVSRSDL 0.998 unsp EHI_043740 397 S SRSVSRSDL 0.998 unsp EHI_043740 425 S KSRNSKSKS 0.997 unsp EHI_043740 427 S RNSKSKSES 0.995 unsp EHI_043740 431 S SKSESSKSL 0.997 unsp EHI_043740 434 S ESSKSLKRS 0.997 unsp EHI_043740 547 S EILDSVSDE 0.992 unsp EHI_043740 751 T YRRITPLEE 0.993 unsp EHI_043740 774 S KEQKSSKKN 0.996 unsp EHI_043740 775 S EQKSSKKNK 0.995 unsp EHI_043740 783 S KKGKSKKGY 0.995 unsp EHI_043740 934 S PRSTSSKYT 0.993 unsp EHI_043740 83 S SSPVSYKFS 0.997 unsp EHI_043740 395 S TPSRSVSRS 0.995 unsp
Showing 1 to 1 of 1 rows

EHI_043740      



Dinesh Gupta lab Translational bioinformatics group, ICGEB, New Delhi, India